使用awk / grep从数据库中提取#，筛选
使用awk / grep从数据库中提取#，筛选
提问于 2013-04-10 00:55:16
我有一个以制表符分隔的大型数据库，如下所示：
1 14933 14933 G A ID=COSN404397;OCCURENCE=1(lung)
1 14948 14948 G A ID=COSN415697,COSN415698;OCCURENCE=2(urinary_tract)
1 69537 69537 G T ID=COSM536198;OCCURENCE=1(lung)
1 69538 69538 G A ID=COSM75742;OCCURENCE=1(ovary)
...我正在尝试使用awk或grep来仅保留>=为3的行(是的，它在整个数据库中都拼写错误！)，但我似乎找不出最好的方法来拆分/扫描第6列……
Stack Overflow用户
发布于 2013-04-10 01:04:51
这段简短的一行代码应该对您有效。顺便说一句，您当前的示例没有任何包含OCCURENCE>=3 :)的行。)
awk -F'OCCURENCE=|\\(' '$2>=3' file好吧..。如果你会打高尔夫球...(=是关键...:D
awk -F'[(=]' '$3>2' file页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/15907913
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