R中的系统发育MANOVA？
R中的系统发育MANOVA？
提问于 2013-05-31 19:37:34
有没有人知道在控制系统发育非独立性的同时执行MANOVA的R包或方法？
谢谢!
回答 1
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2013-05-31 20:11:49
sos包是您的朋友：
library('sos')
findFn('phylogenetic MANOVA')看起来像geiger包，更准确地说，aov.phylo执行系统发生方差或MANOVA。
下面是帮助中的一个示例：
library(geiger)
geo=get(data(geospiza))
dat=geo$dat
d1=dat[,1]
grp<-as.factor(c(rep(0, 7), rep(1, 6)))
names(grp)=rownames(dat)
## MANOVA
x=aov.phylo(dat~grp, geo$phy, nsim=50, test="Wilks")
Multivariate Analysis of Variance Table
Response: dat
Df Wilks approx-F num-Df den-Df Pr(>F) Pr(phy)
group 1 0.27872 3.6229 5 7 0.061584 0.549
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/16856408
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