从ODE - Hill动力学到随机质量作用
从ODE - Hill动力学到随机质量作用
提问于 2013-07-09 17:05:30
我面临着一个将带有ODE的模型转换为随机模型的问题。
原始模型包含两个表达式：
1) k6f2*PKB_S473P^n6/(km6^n6+PKB_S473P^n6))*AS160
2) k9f1*S6K*mTORC1a^n9/(km9^n9+mTORC1a^n9)
用Hill动力学来描述。
我想知道如何将前面的两个表达式转化为质量作用定律，以便能够用随机模拟器模拟它们。
提前感谢大家！
回答 1
Stack Overflow用户
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发布于 2013-07-09 20:32:56
将Hill动力学转换为质量作用动力学不能以令人满意的方式进行，因为对于大浓度，前者导致有界速率，而后者不是。质量作用定律不会表现出希尔动力学所能看到的饱和效应。在最好的情况下，您可以使用质量作用在局部近似Hill函数，但然后您的模拟应该在稳定的稳定状态附近完成。或者，如果引入具有适当系数的中间物种和反应，则可以获得Michaelis-Mentens动力学(单位希尔系数的Hill动力学)。原则上，您甚至可以使用更复杂的中间物种重新获得协作性，但这可能相当复杂。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/17544184
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