问对R中不同大小的向量使用envfit
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Stack Overflow用户

提问于 2017-02-23 07:54:55

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在素食包中使用envfit时，每个参数的大小重要吗？

我有两个数据帧：

bwsp:无脊椎动物的数量

bwenv:五个环境参数(距离、深度、流量、叶绿素、褐藻素)

我的三个参数有相似的量级，另外两个参数小2-3个数量级。较小的参数不会出现在MDS图上。

m <- metaMDS(bwsp)
ef <- envfit(m, bwenv, perm = 1000, na.rm = TRUE)
ef
plot(m)
plot(ef, add = T, p. = 0.05)

发布于 2017-02-23 17:58:19

envfit是基于相关性的，原始大小不会影响其结果。但是，您在绘图中指定了P-value limit p. = 0.05，这可能会删除一些变量。

这是猜测，因为您没有提供可重现的示例。

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/42404550

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