从Mathematica导入数据到Python
从Mathematica导入数据到Python
提问于 2017-05-25 14:42:09
我有一个文本文件，其中包含从Mathematica获得的三维数组(100X100X100)。数据是用逗号和大括号存储的，我想用这个文本文件通过Python来分析和绘制数据。如何在Python中导入数据？我目前使用的是Python 2.7版本。为了在Python中使用matematica，在matematica中存储数据的格式是什么？
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2017-05-25 23:19:23
由于看到人们在ascii中存储如此多的数据让我很痛苦，这里有一种进行二进制交换的方法：
mathematica：
data = RandomReal[{-1, 1}, {3, 4, 5}]
f = OpenWrite["test.bin", BinaryFormat -> True];
BinaryWrite[f, ArrayDepth[data], "Integer32"];
BinaryWrite[f, Dimensions[data], "Integer32"];
BinaryWrite[f, data, "Real64"];
Close[f]python：
import numpy as np
with open('test.bin','rb') as f:
depth=np.fromfile(f,dtype=np.dtype('int32'),count=1)
dims =np.fromfile(f,dtype=np.dtype('int32'),count=depth)
data =np.reshape(np.fromfile(f,dtype=np.dtype('float64'),
count=reduce(lambda x,y:x*y,dims)),dims)注意:如果你在不同的硬件上读/写，你可能会遇到字节顺序问题。(不过很容易处理)
编辑:为了完整起见，使用本地mathematica格式的文本交换如下所示：
mathematica：
m = RandomReal[{-1, 1}, {8, 8}]
m >> out.mpython：
with open('out.m','r') as f: text=f.read()
for rep in (('{','['),('}',']')):text=text.replace(rep[0],rep[1])
array=eval(text)有几个注意事项，第一，eval不应该用于未转换的输入，第二，如果任何值使用科学记数法，或者显然是任何数学符号内容，这将中断。最后，对于大量的输入，它无疑会非常慢。我会认真地使用它，如果你被一个mathematica文件卡住了，并且不能使用mathematica来把它转换成更好的格式。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/44173958
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