R包kernlab中的gausspr函数在线性内核上挂起
R包kernlab中的gausspr函数在线性内核上挂起
提问于 2017-11-14 14:00:53
我正在试验高斯进程模型，特别是在kernlab R包中的实现。我发现模型拟合在去掉线性核时会挂起。分析显示它正忙于通过运算符"%*%“进行矩阵乘法。下面给出了一个可重复使用的示例：
data(iris)
#this doesn't hang
test <- kernlab::gausspr(Species~.,data=iris,type="classification",kernel="rbfdot")
#this hangs with message "Setting default kernel parameters"
test <- kernlab::gausspr(Species~.,data=iris,type="classification",kernel="vanilladot")
#this also hangs
test <- kernlab::gausspr(Species~.,data=iris,type="classification",kernel="polydot", kpar=list(degree=1))
#this doesn't hang
test <- kernlab::gausspr(Species~.,data=iris,type="classification",kernel="polydot", kpar=list(degree=2))知道这是怎么回事吗？非常感谢！
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2018-03-15 10:00:05
需要为每种内核类型指定不同的调优超参数kpar。默认列表选项是kpar =(sigma= 0.1)，它只适用于高斯内核。
每个内核kpar的超参数列表如下：
径向基核函数的
sigma逆核宽度和多项式核的拉普拉斯核"laplacedot".degree, scale, offset对于双曲正切核函数"polydot".scale, offset对于贝塞尔核"tanhdot".sigma, order, degree对于方差分析核"anovadot".
的核
如果您想更好地了解原因，请查看第9页的this pdf中的内核函数。
然而，对于简单的线性内核来说，事情有点棘手，即内核= vanilladot。没有要指定的超参数。我尝试了kpar = NA，但它不起作用。我想出了一种方法，通过特殊的调整，使用多项式来获得线性核的结果：
test <- kernlab::gausspr(Species~.,data=iris,type="classification",
kernel="polydot", kpar=list(degree =1, scale =1, offset =0))页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/47278677
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