如何在Ubuntu Rstudio服务器上使用1个以上的核心(8个可用)来创建R？
如何在Ubuntu Rstudio服务器上使用1个以上的核心(8个可用)来创建R？
提问于 2018-01-18 14:43:05
我想在一个大型数据集(250,000个观测值)上运行lme4包中的glmer过程。该模型在笔记本电脑上运行需要15分钟以上。我们使用的是基于Ubuntu的Rstudio服务器。问题是这台服务器上有8个核心可用，但当我运行glmer过程时，只使用了其中的1个，并且需要超过1个小时才能获得结果……我如何才能解决这个问题并提高时间效率？我在谷歌上发现我可能不得不使用parallel程序，但我对这些信息学程序一点也不熟悉，对我来说它们看起来非常复杂……有没有人可以用一个简单的程序来解决这个问题？
我知道它们已经是关于这个话题的问题了，但那是7年前(R package that automatically uses several cores?)或3年前(How can I make R use more CPU and memory?)。我知道R包和过程正在发展，我希望您能帮助我更新这个主题(希望是一个简单、简单的解决方案)。
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2018-01-30 07:45:50
下面的内容会有帮助吗？
library(parallel)
f <- function(i) {
lmer(Petal.Width ~ . - Species + (1 | Species), data = iris)
}
cls <- makeCluster(detectCores())
clusterEvalQ(cls, library(lme4))
mod <- parLapply(cls, 1, f)
stopCluster(cls)页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/48315268
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