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社区首页 >问答首页 >关于ImageJ (斐济)的批量分析

关于ImageJ (斐济)的批量分析
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Stack Overflow用户
提问于 2018-06-21 21:31:23
回答 1查看 117关注 0票数 0

您好,我有430个文件,我需要分析其中的文件夹树

我使用的插件是这个:http://dev.mri.cnrs.fr/projects/imagej-macros/wiki/Intensity_Ratio_Nuclei_Cytoplasm_Tool

分析前的文件需要转换为16位灰度图像,然后对其中一些文件(都具有相同的文件起始名称,例如,DAPI.tif,DAPI2.tif)应用特定的阈值,然后每个DAPI X.tif转换为掩码并使用该插件进行分析,然后使用其他两个文件(TRITC X.tif和FITC X.tif)进行分析,然后保存结果。

最好的方法是什么,因为我需要几个小时来手动完成这项工作?顺便说一句,我是一个初学者,当涉及到imageJ,所以详细的说明将是有用的。

谢谢你们

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回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2018-06-27 04:36:28

请看一下ImageJ维基的这个页面:

https://imagej.net/Batch

票数 0
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/50969846

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