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问R中UNIANOVA的语法
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Stack Overflow用户

提问于 2018-11-20 04:35:18

回答 1查看 120关注 0票数 1

我正在尝试在R中为类型I unianova复制以下SPSS语法

UNIANOVA FinH BY Site Provenance Block Genotype WITH SoilNkh dDDSP dDDSP2
/RANDOM=Block Genotype
/METHOD=SSTYPE(1)
/INTERCEPT=INCLUDE
/POSTHOC=Site (SNK) 
/SAVE=PRED RESID
/CRITERIA=ALPHA(0.05)
/DESIGN=SoilNkh Site dDDSP dDDSP2 Provenance Provenance*Site Genotype(Provenance)
Block(Site).

在地点和种源固定的情况下，嵌套在种源中的基因型和嵌套在地点中的区块是随机的，并且是dDDSP、dDDSP2和SoilNkh。它应该是I型方差分析。

就R语法而言，我能想到的最好的方法是

m11 <- lme(FinH ~ 1 + SoilNkh + Site + dDDSP + dDDSP2 + Provenance + Site:Provenance, 
    random = (1|Provenance/Genotype) + (1|Site/Block), data=spss)
Anova(m11,type="I")

和相当多的变种(这是不可能的:) )，但无济于事。坦率地说，我也迷失在谷歌提供的关于这个主题的所有东西中。

我非常感谢在翻译语法方面的任何帮助。

提前感谢！

spss

anova

syntax

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2019-02-02 03:37:56

这似乎让我更接近了：

FinH <- lmer(FinH~SoilN + Site + dDDSP + dDDSP2 + Provenance +
                  Site:Provenance +(1|Provenance/Genotype) + (1|Site/Block),
              REML = FALSE,
              data=subset(spss,Year=="2011"))

但正如你所看到的，它们并不完全相同。此外，我还没有成功地计算随机效果的统计数据。当然，我将继续工作，以复制分析，但欢迎进一步的提示(和技巧)。

票数 -1

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/53382250

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