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问Bash命令无法在Jupyter Notebook中执行
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Stack Overflow用户

提问于 2019-02-18 20:49:53

回答 3查看 1.5K关注 0票数 2

我正在尝试从Jupyter Notebook内部执行一个Bash命令，该命令将一个随机数写入一些文件。我想发出的命令是

echo $(( RANDOM )) &> {output_files[i]}

其中output_files是输出文件名列表。我不知道如何将Python变量output_files[i]成功地放入Bash命令中，所以我将整个命令创建为一个字符串，并尝试通过Notebook执行：

# Create a list of 5 filenames
output_files = [os.path.join(os.getcwd(), 'random-%s.txt' % i) for i in range (5)]

# Write random number to each file
for i in range (5):
    command = "echo $(( RANDOM )) &> " + output_files[i]
    print(command)
    !{command}

当我尝试这样做时，创建了./random-0.txt等文件，但没有向其中写入任何数字-它们是空的。但是，当我直接在终端中运行创建的命令时，它完全按照预期工作。创建这些文件时，每个文件都包含一个随机数。print(command)生产线生产

echo $(( RANDOM )) &> /filepath/random-0.txt
0
echo $(( RANDOM )) &> /filepath/random-1.txt
echo $(( RANDOM )) &> /filepath/random-2.txt
echo $(( RANDOM )) &> /filepath/random-3.txt
echo $(( RANDOM )) &> /filepath/random-4.txt

对这个问题的Web搜索在Stack Overflow和博客上找到了几个类似的问题，但所有这些问题的结果要么是“Windows上不存在Bash命令”，要么是“您可以使用'!‘在Jupyter Notebook中执行Bash命令！”没有更多关于它是如何工作的信息，所以我可以调试这样的问题。

我该怎么做呢？

python

bash

jupyter-notebook

回答 3

Stack Overflow用户

发布于 2019-02-18 21:06:44

为什么不在python中做所有的事情呢？使用randint()函数的random模块生成您的数字。定义您选择的范围并将其包含在(..)中

import os
import random
output_files = [os.path.join(os.getcwd(), 'random-%s.txt' % i) for i in range (5)]
for of in output_files:
    with open(of, "w") as text_file:
        text_file.write(str(random.randint(99,1000)))

票数 3

Stack Overflow用户

发布于 2019-02-18 20:57:44

你好，欢迎来到Stack Overflow

据我所知，您的问题不是由于使用!执行bash命令引起的，而是因为您没有用output_files[i]的实际内容“替换”它。当您运行循环时

# Write random number to each file
for i in range (5):
    command = "echo $(( RANDOM )) &> {output_files[i]}"

在每次迭代中，command将是文字字符串"echo $(( RANDOM )) &> {output_files[i]}"。与在第一行中一样，您应该使用字符串替换将占位符替换为output_files[i]的内容

# Write random number to each file
for i in range (5):
    command = ("echo $(( RANDOM )) &> {%s}"%output_files[i])

要调试此类问题，检查有问题的变量的值通常是一个很好的开始。最简单的方法是添加print (x)行，其中x是要检查其内容的变量。

票数 2

Stack Overflow用户

发布于 2019-02-18 22:14:18

作为对这里的一个答案的回应，让我展示一下如何使用subprocess.check_call()来做到这一点。

如果你想在subprocess中使用外壳重定向，你必须有一个外壳：

for i in range(5):
    subprocess.check_call('echo "$RANDOM" >random-{}.txt'.format(i), shell=True)

你可以表面上试着去掉shell=True ...但是echo和$RANDOM也是外壳特性。

一个纯Bash解决方案应该是

!for i in {0..4}; do printf "%s\n" "$RANDOM" >random-"$i".txt; done

(顺便说一句，$((RANDOM))中的数字上下文没有错，但完全是多余的。)

可以使用{...}将Python表达式插入到!命令行中。例如，以下方法也适用：

!{';'.join(['echo $RANDOM >random-{}.txt'.format(i) for i in range(5)])}

在iPython中，我可以使用您尝试的构造产生预期的结果：

in [15]: for i in range(2):
    ...:     c='echo $RANDOM >random-{}.txt'.format(i)
    ...:     !{c}
    ...:

in [16]: !tail random-*.txt
==> random-0.txt <==
15637

==> random-1.txt <==
32475

如果Jupyter使用的是iPython内核，我想这也应该适用于您。

还要注意我是如何使用普通的旧>重定向而不是&> -真的真的真的没有合理的理由希望错误消息被重定向到文件；如果一个文件不能被创建，你完全不知道是什么失败了，为什么失败了，甚至是它失败了。(实际上，我怀疑这就是您的问题所在。权限被拒绝？磁盘已满？我们不知道。)

不过，我建议您使用Python来执行这个简单的任务。运行子进程来执行一些在Python中相对容易的事情是低效和笨拙的，而且有些脆弱。

票数 2

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/54747724

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