How do I fix error code“在netmeta package R中研究错误的比较次数
How do I fix error code“在netmeta package R中研究错误的比较次数
提问于 2020-08-21 05:47:53
我想对包含多个和单个治疗臂的研究进行网络meta分析。
下面是我的数据结构：
data.frame': 85 obs. of 5 variables:
$ TE : num -0.758 -0.695 -0.288 -0.511 -0.288 ...
$ seTE : num 0.6191 0.2667 0.0341 0.0758 0.1178 ...
$ treat1 : Factor w/ 31 levels "Boil_promo","Chem",..: 6 26 26 18 9 9 3 9 16 26 ...
$ treat2 : Factor w/ 3 levels "Act","Pa","Pb": 2 2 2 2 2 3 3 2 2 2 ...
$ studlab: Factor w/ 63 levels "Altmann2018",..: 1 2 3 4 5 6 7 8 8 9 ...我有4个研究，2个治疗臂，5个3个治疗臂，2个4个治疗臂。有三种类型的对照:被动对照、主动对照和安慰剂对照。总共有31种治疗类型。
运行以下代码后：
m.netmeta <- netmeta(TE = TE,
seTE = seTE,
treat1 = treat1,
treat2 = treat2,
studlab = paste(net.meta$studlab),
data = net.meta,
sm = "RR",
comb.fixed = TRUE,
comb.random = FALSE,
reference = "Pa",
details.chkmultiarm = TRUE,
sep.trts = " vs ")我得到了这个错误：
Error: The following studies have a wrong number of comparisons: 'Brown2008', 'Crump2005', 'Ecrumen2015', 'Francis2016', 'Luby2004', 'Opryszko2010', 'Reller2003', 'Sinharoy2017'
Please provide data for all treatment comparisons (two-arm: 1; three-arm: 3; four-arm: 6, ...).有人知道我该怎么处理这件事吗？
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2020-11-30 04:10:42
netmeta要求数据将每个成对比较作为多臂研究的单独行列出。您收到的错误消息表明netmeta检测到某些研究(即Brown2008、Crump2005、Ecrumen2015、Francis2016、Luby2004、Opryszko2010、Reller2003、Sinharoy2017)没有发生这种情况。
您的帖子表明您的许多研究是多臂研究，您提供的信息表明您可能没有以netmeta预期的格式设置数据。举几个例子：
- 您的描述表明您可能限制了您在treat2中放入的内容(即，仅包括主动、被动和安慰剂控制)。treat2中的内容完全取决于研究的组成。下面的假设示例对此进行了更多的解包。
- 你对研究组成的描述("4个研究有2个治疗臂，5个研究有3个治疗臂，2个研究有4个治疗臂“)似乎与预期的行数不匹配。例如，为什么学生实验室有63个级别？我不清楚这如何与预期的31行(对应于成对比较的数量)配对:2个处理臂=4行的4个研究，3个处理臂= 15行的5个研究，以及4个处理臂= 12行(4 + 15 + 12 =31)的2个研究。
例如，如果Brown2008具有手臂MedicationX、MedicationY和安慰剂，您将需要单独的行来表示MedicationX与MedicationY、MedicationX与安慰剂和MedicationY与安慰剂，而不仅仅是MedicationX与安慰剂和MedicationY与安慰剂。我建议您从那里开始调试。
另一件可能导致该错误的事情是，如果您有碰巧具有相同AuthorYear标签的不同发布。如果是这样的话，你可以尝试给“罪魁祸首”研究加上唯一的标识符。
页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/63513572
复制相关文章
相似问题
腾讯云开发者
