问从远程检出存储库，但当我执行git状态时，文件显示为已修改-如何修复？

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我正在使用Windows和Git，并且我已经修改了一个文件。无论我做了多少次git添加和提交，文件都一直显示为已修改，而我不能执行git拉取--rebase。我想我做错了什么，搞砸了本地的Git repo，所以我决定从github克隆repo到一个全新的目录中。令我惊讶的是，即使在这个新的目录树中，当我执行git状态时，相同的文件也显示为已修改-就好像它在github (远程)存储库中被以某种方式修改了一样，这对我来说没有任何意义。此外，克隆的本地存储库中的文件版本没有我在github上查看代码时看到的最新版本的代码。我该如何解决这个问题呢？我担心其他克隆代码的人也会遇到同样的问题。(显然只有我看到了这个问题--我没有设法破坏github代码库，这让我相信这是一个git/windows问题。)就我所认为的错误而言，当我修改一个文件并执行git add时，我错误地拼写了目录路径，使用小写字母而不是大写字母，然后添加一个文件导致另一个拼写正确的路径显示为modified，反之亦然。我不知道是否在windows上创建了符号链接--文件内容是相同的。但有人会认为克隆(通过Eclipse)到一个全新的目录树中会使这不是问题。