如何在Bash中检查列内容
如何在Bash中检查列内容
提问于 2020-12-30 18:31:59
我被这个问题卡住了。使用Bash，我们必须检查.txt文件是否为两列提供数据，如果不存在，则必须清空注释。数据是一个txt文件，如下所示：
#pacId locusName Best-hit-arabi-name arabi-defline
23158591 Lus10000002.g AT1G75330.1 ornithine carbamoyltransferase
23170978 Lus10000003.g AT1G14540.1 Peroxidase superfamily protein我必须清空没有"Best-hit“和"arabi-defline”列的注释
我正在考虑做一个while脚本来读取每一行，但我不知道用什么代码来检查列是否为空。
谢谢你帮我的忙！
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2020-12-30 23:06:00
我必须清空没有"Best-hit“和"arabi-defline”列的注释
我假设你的意思是：
我必须删除不包含
Best-hit和arabi-defline的值的行
因此，如果是这样的话，这里有一个使用awk的简单解决方案
awk '{if ($3 && $4){print $0}}' test.txt我认为在这种情况下，awk比bash更合适，但你也可以使用bash来做这件事，比如：
while read -r pacId locusName bHAN aD; do [[ $bHAN && $aD ]] && echo "${pacId} ${locusName} ${bHAN} ${aD}"; done < test.txt当然，如果您想更改默认分隔符，而不是任何空格，您可以像这样覆盖IFS：
while IFS='\t' read -r pacId locusName bHAN aD; do [[ $bHAN && $aD ]] && echo -e "${pacId}\t${locusName}\t${bHAN}\t${aD}"; done < test.txt对于awk也是如此，您只需使用-F来更改默认分隔符。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/65505523
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