在这个tutorial和两个installation steps之后,我想运行SimLoRD。
在Ubuntu 18.04上,使用Python 3.9 venv:
conda install -c bioconda simlord
UnsatisfiedError

我已经在Windows和Linux上用不同版本的Anaconda和Python尝试过了,但运气不佳。
建议使用pip install simlord==1.0.4 via。Windows 10
ERROR: Command errored out with exit status 1: python setup.py egg_info Check the logs for full command output.

发布于 2021-04-04 18:26:15
Solution at BioStars。TLDR;Python 3.6.5是用于安装和运行SimLoRD的最新稳定版本
发布于 2021-04-04 03:57:22
我不确定这是否完全适用于您的设置,因为我不知道您的完整分析工作流是什么,也不知道您有哪些其他依赖项,但您可以通过pip安装simlord
(py39) dbell30@dbell30-VirtualBox:~$ pip install simlord==1.0.4如果成功,请检查pip list的输出
发布于 2021-04-05 18:50:48
尝试创建一个新环境。就像这样
conda create -n simlord -c conda-forge -c bioconda -c defaults simlord注意,这里的三个通道是用于基于Bioconda的安装的the recommended channel priority。
https://stackoverflow.com/questions/66934411
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