Conda未能安装VEP
Conda未能安装VEP
提问于 2021-12-12 17:49:28
我试图在conda环境中安装VEP，但一直失败。我尝试过正常的安装过程：
conda install -c bioconda ensembl-vep 但是，获得以下错误，这些错误运行了大约一个小时，最终失败了：
$ conda install -c bioconda ensembl-vep
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.
Solving environment: failed with repodata from current_repodata.json, will retry with next repodata source.
Collecting package metadata (repodata.json): done
Solving environment: | ^[failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve.
Solving environment: - 我也尝试过创建一个新的环境并进行安装，但仍然失败。
conda create -n ensembl-vep -c conda-forge -c ensembl-vep 还有更多的想法吗？
Stack Overflow用户
发布于 2021-12-12 20:59:56
以下YAML在linux-64和osx-64平台上为我工作：
vep.yaml
name: vep
channels:
- conda-forge
- bioconda
- defaults
- etetoolkit # this provides a t_coffee build for osx
dependencies:
- ensembl-vep环境状态：
然而，对于osx-64，我发现channel_priority必须设置为flexible，否则Conda必须屏蔽一些必须从Bioconda通道获得的必需包。
CONDA_CHANNEL_PRIORITY=flexible mamba env create -n vep -f vep.yaml页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/70326157
复制相关文章
相似问题
腾讯云开发者
