问在R中安装更老版本的生物导体mixOmics软件包的问题

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我花了一天的时间在R中加载我保存在renv锁文件中的适当的包版本。

我使用了RVAideMemoire包，它与生物导体中的mixOmics捆绑在一起，不能使用renv::restore()自动加载。

我按照这里概述的步骤安装适当版本的生物导体(3.11)，以获得moxOmics版本6.12.1。

R how to install a specified version of a bioconductor package?

不幸的是，我最终得到了6.14.1版的mixOmics。我试图使用以下方法加载早期版本：

BiocManager::install("mixOmics", version = '6.12.1')

导致以下错误：

Error: version '6.12.1' must have two components, e.g., '3.7'

这似乎有点不清楚，我认为最后附加的".1“可能会导致问题，但我尝试加载的版本省略了最后一个".1”，如下所示：

BiocManager::install("mixOmics", version = "6.12")

我又犯了一个错误

Error: unknown Bioconductor version '6.12'; see https://bioconductor.org/install

我有点不知所措。只要renv::restore()包安装持续失败，mixOmics函数就不会完成更新，所以在解决这个问题之前，我似乎有点卡住了。

编辑只是为了提供更多关于重命名错误的信息，下面是我得到的消息：

错误:除了:警告消息之外，无法检索包“mixOmics”：

1:在"C:/Users/Corey/AppData/Local/Temp/RtmpuYYvKB/renv-tempdir-3d7050aa2ac3/renv-download-config-3d7076f57e1c"‘(“system2”，args$data()，stdout = TRUE，stderr = TRUE)中:运行命令’curl‘-config system2拥有状态22

2:在下载程序( URL，destfile，type，requested )中: curl：(22)请求的URL返回错误: 404

3:在"C:/Users/Corey/AppData/Local/Temp/RtmpuYYvKB/renv-tempdir-3d7050aa2ac3/renv-download-config-3d701ff05e24"‘(“system2”，args$data()，stdout = TRUE，stderr = TRUE)中:运行命令’curl‘-config system2拥有状态22

4:在下载程序( URL，destfile，type，requested )中: curl：(22)请求的URL返回错误: 404`

在尝试使用的初步建议之后

options(renv.settings.bioconductor.version = "3.11") renv::install("bioc::mixOmics@6.12.1")

我发现了以下错误：

‘getOption(“repos”)取代生物导体标准存储库，详见’？存储库‘以获取替换存储库: CRAN：https://cran.rstudio.com

查询存储库以获得可用的二进制包..。完成了！

查询存储库以获得可用的源包..。完成了！检索https://bioconductor.org/packages/3.12/bioc/src/contrib/Archive/mixOmics/mixOmics_6.12.1.tar.gz ..。检索https://bioconductor.org/packages/3.12/data/annotation/src/contrib/Archive/mixOmics/mixOmics_6.12.1.tar.gz ..。检索https://bioconductor.org/packages/3.12/data/experiment/src/contrib/Archive/mixOmics/mixOmics_6.12.1.tar.gz ..。检索https://bioconductor.org/packages/3.12/workflows/src/contrib/Archive/mixOmics/mixOmics_6.12.1.tar.gz ..。检索https://bioconductor.org/packages/3.12/books/src/contrib/Archive/mixOmics/mixOmics_6.12.1.tar.gz ..。检索https://cran.rstudio.com/src/contrib/Archive/mixOmics/mixOmics_6.12.1.tar.gz ..。

错误:无法检索包“mixOmics”

此外:有24个警告(使用警告()查看它们)