用pheatmap制作热图的连续颜色图
用pheatmap制作热图的连续颜色图
提问于 2022-02-28 17:41:48
我想弄清楚如何使用pheatmap包，并制作一个连续的颜色编码热图。
我想用三种颜色，红色，白色和蓝色作为我的地图，其中白色= 0，蓝色代表负数，红色代表正数。我希望它是连续的，而不是任何东西都是0=白色，正红色，但更多的是从固体红色到更轻的过渡，直到白色。
我在文档中找不到它，所以也许是因为我对如何让它工作缺乏了解。
这是我目前的代码。
pheatmap(heatmap_matrix,
cluster_rows = T,
cluster_cols = T,
color = c("blue", "white", "red"),
angle_col = 90)谢谢!
回答 1
Stack Overflow用户
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发布于 2022-02-28 17:47:23
您可以使用colorRampPalette提供一个很长的转换颜色矢量。
set.seed(1)
heatmap_matrix <- matrix(rnorm(400), nrow = 20)
pheatmap(heatmap_matrix,
cluster_rows = T,
cluster_cols = T,
color = colorRampPalette(c("blue", "white", "red"))(100),
angle_col = 90)
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/71298942
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