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问热图图中的重叠标签
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Stack Overflow用户

提问于 2022-06-18 17:14:12

回答 2查看 166关注 0票数 1

我正在制作一个热图通过cooccur包，但我得到了重叠的物种名称。如何解决这个问题？这一情节是由下列代码制作的：

M <- cooccur(mat = M, type = "spp_site", thresh = T, spp_names = TRUE, prob = "hyper")
plot(M, plotrand = TRUE)

heatmap

overlapping

ggplot2

回答 2

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2022-06-19 15:46:34

不幸的是，作者没有在函数中使用定义的主题。在这篇文章中，How to change default font size in R chart @Gregor给出了一个很好的答案。您可以做的是创建自己的theme，就像在ggplot中一样。这里我以finches数据集为例：

library(cooccur)
data("finches")
cooccur.finches <- cooccur(mat=finches,
               type="spp_site",
               thresh=TRUE,
               spp_names=TRUE)
summary(cooccur.finches)
plot(cooccur.finches,cex.sub = 0.1)

p <- plot(cooccur.finches)
p + theme_bw(base_size = 28) +
  theme(axis.text = element_blank(), 
        axis.ticks = element_blank(), 
        plot.title = element_text(vjust = -4, face = "bold"), 
        panel.background = element_rect(fill = "white", colour = "white"), 
        panel.grid = element_blank(),
        legend.position = c(0.9, 0.5))

输出：

我建议使用来自ggplot的theme选项。这里有一个很好的帖子，可以肯定地帮助你：Changing font size and direction of axes text in ggplot2

票数 0

Stack Overflow用户

发布于 2022-06-19 18:06:12

在开始修改字体大小之前，您应该检查这是否只是R不正确地猜测设备大小而造成的人为问题。我注意到，当用dev.copy将一个情节保存为PDF时，这种情况经常发生，下面的解决方法总是为我解决这个问题：

调整屏幕上的绘图窗口的大小。
通过再次调用绘图命令重新绘制绘图。

票数 0

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/72671222

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