我是一名PhD学生,研究微生物组16S rRNA序列数据。我有一位前一位学生的phyloseq规范化代码,我想问是否有人能帮助解释它到底在做什么:
ps_norm <- transform_sample_counts(ps, function(x) x / sum(x) )
谢谢
发布于 2022-06-19 03:48:52
您可以找到transform_sample_counts
这里的文档。
该函数根据用户提供的函数转换分类法丰度矩阵的样本计数。每个样本的计数将分别转换。这种方法不可能进行样本间的交互/比较。
https://stackoverflow.com/questions/72674133
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