问归一化法
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Stack Overflow用户

提问于 2022-06-19 03:45:06

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我是一名PhD学生，研究微生物组16S rRNA序列数据。我有一位前一位学生的phyloseq规范化代码，我想问是否有人能帮助解释它到底在做什么：

ps_norm <- transform_sample_counts(ps, function(x) x / sum(x) )

谢谢

发布于 2022-06-19 03:48:52

您可以找到transform_sample_counts 这里的文档。

该函数根据用户提供的函数转换分类法丰度矩阵的样本计数。每个样本的计数将分别转换。这种方法不可能进行样本间的交互/比较。

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/72674133

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