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社区首页 >问答首页 >如果我想展示蛋白质-蛋白质相互作用的力量,网络模型合适吗?

如果我想展示蛋白质-蛋白质相互作用的力量,网络模型合适吗?
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Stack Overflow用户
提问于 2022-07-11 15:00:29
回答 1查看 24关注 0票数 0

我正在做一个实验,测量网络中蛋白质对之间的相互作用。我也有一个积极和消极的对照,以显示“最少”和“最多”的相互作用量,蛋白质可能有可能。

我想做一个网络模型,但是我不确定如何用数值数据来显示交互的强度。例如,如果阳性对照有"50“和负控制"5”(我使用Miller单位),那么如何使用颜色梯度来显示我正在研究的蛋白质-蛋白质相互作用的强度。

这个链接“在网络上可视化表达式数据”会是一个合适的协议吗?https://cytoscape.org/cytoscape-tutorials/protocols/basic-data-visualization/#/3

提前感谢您的帮助。

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回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2022-07-14 14:19:46

我的建议是在你的边缘使用一个单尾梯度--可能使用Viridis调色板或ColorBrewer序列。我可能也会用一个宽度梯度来强调相互作用的强度。

-滑板车

票数 0
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原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/72940603

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