首页
学习
活动
专区
圈层
工具
发布
首页
学习
活动
专区
圈层
工具
MCP广场
社区首页 >问答首页 >glmmTMB中的收敛准则--我的选择是什么?

glmmTMB中的收敛准则--我的选择是什么?
EN

Stack Overflow用户
提问于 2022-07-27 09:06:05
回答 1查看 113关注 0票数 2

当使用R-package glmmTMB() {glmmTMB} (参见具有手动和小插画链接的CRAN)时,我知道在处理模型的收敛性时,我有一些选择。更具体地说,有一个control =参数可以传递glmmTMBControl()参数,手册中的部分如下:

此外,其中一个小片段--即用glmmTMB进行故障排除 --明确地谈到了如何处理收敛问题。然而,我现在的关键点是,据我所知,无论何时提到glmmTMBControl(),它总是以以下两种方式之一:

  • glmmTMBControl(optCtrl=list(iter.max=1e3,eval.max=1e3)),即增加迭代次数
  • glmmTMBControl(optimizer=optim, optArgs=list(method="BFGS")),即尝试不同的优化器

关于第二个问题,给我留下的印象是,除了这里显示的选项之外,我还有多个选项,因为“优化器参数可以是任何优化(最小化)函数.”以及以下措辞:

然而,我无法找到任何其他选项,我实际上可以把它作为我的optimizer=,因为它看起来确实是上面所示的例子,如果有人能提供一个列表,我会很感激。

P.S.:我正在尝试使用glmmTMB的收敛准则,因为它似乎通常估计的方差分量比PROC MIXED在SAS中的相同模型要小一些。

EN

回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2022-10-10 12:21:44

来自?glmmTMB

“优化器”参数可以是任意优化(极小)函数,条件是:·前三个参数依次为起始值、目标函数和梯度函数; ·该函数还采用“控制”论点; ·函数返回一个包含元素(至少)‘par’、‘objective’、‘收敛’(如果收敛成功的话为0)和‘message’的列表(‘glmmTMB’通过将‘value’组件重命名为‘objective’来自动处理来自‘optim()’的输出。)

基本R中满足这些要求的选项(基于梯度的最小化器)是nlminboptim,带有method="BFGS""L-BFGS-B""CG"。您还可以查看optimxnloptr提供的优化器,但是您可能需要编写一个包装器函数,以确保它们满足上述条件.

票数 1
EN
页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/73135114

复制
相关文章

相似问题

领券
问题归档专栏文章快讯文章归档关键词归档开发者手册归档开发者手册 Section 归档