问Seurat数据可视化
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Stack Overflow用户

提问于 2022-08-11 09:14:25

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嗨，我正在使用公共数据pbmc来练习单细胞分析，我在这一点上被这个错误信息卡住了。刚从R开始，遇到困难，有人能给一个指针吗？非常感谢

山脊地块-从格格里奇。可视化每个集群中的单细胞表达式分布

代码: RidgePlot(pbmc3k.final，features = features，ncol = 2)

FetchData.Seurat中的错误(对象=对象，vars =功能，槽=槽)：找不到对象的特性

发布于 2022-09-21 20:34:12

您需要定义您想要看到的“功能”。

因此：

features = c('Sox2', 'Sox9') #etc, as an example

或者，您可以将它们添加为一个称为特性的变量：

features <- c('Sox2', 'Sox9') 

RidgePlot(pbmc3k.final, features = features, ncol = 2)
#if they are mouse genes, human genes are all caps.

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/73318189

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