如何将.hdf文件转换为数据集？
如何将.hdf文件转换为数据集？
提问于 2022-08-11 22:05:39
我在这里使用一个文件：http://orca.science.oregonstate.edu/1080.by.2160.monthly.hdf.vgpm.m.chl.m.sst.php
untar(tarfile = "http://orca.science.oregonstate.edu/data/1x2/monthly/vgpm.r2018.m.chl.m.sst/hdf/vgpm.m.2010.tar", exdir = "./foo")我得到错误: ar.exe:错误打开归档:未能打开'http://orca.science.oregonstate.edu/data/1x2/monthly/vgpm.r2018.m.chl.m.sst/hdf/vgpm.m.2010.tar‘
因此，我不得不手动下载该文件并解压缩它(这就是为什么不能在这里提供一个可重复的示例)。在里面有.hdf格式的文件：
我也看不懂：
library(ncdf4)
ncin <- nc_open(".\\vgpm.m.2010\\vgpm.2010001.hdf")
ncin
lon <- ncvar_get(ncin,"fakeDim0")
head(lon)
lat <- ncvar_get(ncin,"fakeDim1")
head(lat)
fillvalue <- ncatt_get(ncin,"npp","_FillValue")您能帮助解释为什么我不能utar文件和为什么.hdf文件没有填充值吗？
回答 2
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2022-08-12 02:33:32
- ，您应该能够在下载了该文件之后，对它进行
untar。先将文件下载到工作目录，然后从工作目录：untar("vgpm.m.2002.tar", exdir = "mydir")中解压。你的问题很可能与连接有关。可能有许多原因是特定于您的计算机的设置。您需要分别对此进行故障排除。
- 一旦解压缩目录，其中的内容就不是.hdf文件。它们是压缩的 .hdf文件(因此它们的文件名以.gz结尾)。您需要解压缩：
library(R.utils)
gunzip("mydir/vgpm.2002335.hdf.gz", remove = FALSE)- 一旦真正拥有了.hdf文件，就需要打开它，然后读取它。使用
ncdf4是正确的，因为它可以容纳多种.hdf文件格式。一些旧格式需要不同的软件包或软件。
要打开和读取它，需要两个不同的函数，即ncvar_get()和nc_open()。
library(ncdf4)
dat <- nc_open("mydir/vgpm.2002335.hdf", write = TRUE)
ncvar_get(dat)请注意，如果您没有完成文档中详细解释的先决条件设置，这些功能将无法工作。例如：
-- netCDF库和HDF5库都必须安装在您的计算机上，这样R接口才能运行.
。
Stack Overflow用户
发布于 2022-08-12 15:15:17
我还试着用它来渲染它:它也很有用：
library(raster)
x <- raster("~.\\vgpm.2010001.hdf")
extent(x) <- extent(-180, 180, -90, 90)
crs(x) <- "+proj=longlat +datum=WGS84"
NAvalue(x) <- -9999
#plot(x)
f1<- as.data.frame(x, xy=TRUE) 页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/73327326
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