如何在Python中翻转MRI图像
如何在Python中翻转MRI图像
提问于 2022-09-21 06:08:53
我试图翻转图片1中显示的图像，以匹配图像2的方向，但我不确定如何。
这就是如何以形象为导向：
有什么想法吗?例如，我如何在Python中使用SimpleITK或nibabel来实现这一点？
回答 1
Stack Overflow用户
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发布于 2022-09-21 11:39:38
假设您正在从支持定向的文件格式中读取这两个图像。在SimpleITK中，您可以执行以下操作来获得和近似设置使用翻转和镜像操作的方向：
import SimpleITK as sitk
img1 = sitk.ReadImage(filename)
input1_orientation = sitk.DICOMOrientImageFilter_GetOrientationFromDirectionCosines(img1.GetDirection())
print(f"Input Orientation: {input1_orientation}")
oriented_img1 = sitk.DICOMOrient(img1, desiredCoordinateOrientation='LPS')如果文件中缺少定位，请首先考虑如何对图像进行上游处理，以正确保存元数据。其次，将正确的定位信息设置为图像的方向余弦矩阵。最后，如果不能保存或恢复定向，则可以使用PermuteAxesImageFilter和FlipImageFilter的组合。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/73796046
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