错误:对包“kernlab”的编译失败；在运行某个函数“dcauchy”时似乎失败
错误:对包“kernlab”的编译失败；在运行某个函数“dcauchy”时似乎失败
提问于 2022-11-28 17:41:08
我在试图为R安装内核时出错，我的R版本是3.5.2。我的操作系统是ChromeOS 108.0.5359.58测试版(64位)，Debian 10 (buster)。处理器是一个英特尔m3-8100Y (64位)。
我得到的错误似乎没有报告时，试图寻找问题的内核或dcachy.c，虽然如果有一个相同的问题之前，我的道歉！
> install.packages("kernlab", type="source")
Installing package into ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/kernlab_0.9-31.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1215549 bytes (1.2 MB)
==================================================
downloaded 1.2 MB
* installing *source* package ‘kernlab’ ...
** package ‘kernlab’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
g++ -std=gnu++11 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-3.5.2=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c brweight.cpp -o brweight.o
g++ -std=gnu++11 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-3.5.2=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c ctable.cpp -o ctable.o
g++ -std=gnu++11 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-3.5.2=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c cweight.cpp -o cweight.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-3.5.2=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c dbreakpt.c -o dbreakpt.o
gcc -std=gnu99 -I"/usr/share/R/include" -DNDEBUG -fpic -g -O2 -fdebug-prefix-map=/build/r-base-3.5.2=. -fstack-protector-strong -Wformat -Werror=format-security -Wdate-time -D_FORTIFY_SOURCE=2 -g -c dcauchy.c -o dcauchy.o
dcauchy.c: In function ‘dcauchy’:
dcauchy.c:110:13: error: expected ‘)’ before ‘FCONE’
wa, &inc FCONE);
^~~~~~
)
dcauchy.c:132:67: error: expected ‘)’ before ‘FCONE’
F77_CALL(dsymv)("U", &n, &one, A, &n, s, &inc, &zero, wa, &inc FCONE);
^~~~~~
)
dcauchy.c:156:67: error: expected ‘)’ before ‘FCONE’
F77_CALL(dsymv)("U", &n, &one, A, &n, s, &inc, &zero, wa, &inc FCONE);
^~~~~~
)
make: *** [/usr/lib/R/etc/Makeconf:162: dcauchy.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘kernlab’
* removing ‘/home/user/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.5/kernlab’
The downloaded source packages are in
‘/tmp/RtmpUQr5y3/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages("kernlab", type = "source") :
installation of package ‘kernlab’ had non-zero exit status我试着四处寻找解决方案，但似乎没有发布任何信息。我期望内核安装正确，因为它是需要的某些部分的插入包也正常工作，我正在使用。不幸的是，当我运行install.packages("kernlab")时，我得到了上面的错误。这包括尝试用sudo运行R。
回答 1
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2022-12-02 00:11:06
万一将来有人有这个问题，我确实设法让它起作用了。我注意到，我也无法在Windows上的Debian上安装内核，但是它在windows中可以工作。因此，一种解决方案显然是不使用linux。
当我发现install.packages("kernlab")失败的地方似乎是linux时，我做了一些谷歌搜索，发现内核在debian上是可用的。
因此，sudo apt-get install r-cran-kernlab做到了这一点。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/74604499
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