在Mac M1上使用scikit bio的问题
在Mac M1上使用scikit bio的问题
提问于 2021-08-18 22:01:20
我试着通过在文档中运行conda install -c https://conda.anaconda.org/biocore scikit-bio来安装scikit-bio，但是通过python -m skbio.test验证安装会产生以下错误：Error while finding module specification for 'skbio.test' (ModuleNotFoundError: No module named 'skbio')。
接下来，我尝试使用pip install numpy和pip install scikit-bio进行安装，但这产生了大量错误。无论如何，尝试了安装测试，得到了相同的ModuleNotFoundError。
我正在使用MacBook Air 2020和M1处理器，所以不确定这是否是问题的原因。
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2022-01-14 14:15:27
我不知道你是否仍然有问题，但对我有效的解决方案是使用sse2neon包：https://github.com/DLTcollab/sse2neon。
下面的说明应该有效
git clone https://github.com/biocore/scikit-bio
cd scikit-bio
wget https://github.com/DLTcollab/sse2neon/blob/master/sse2neon.h打开simde-sse2.h文件并替换以下两行中的每一行：
#include <xmmintrin.h>
#include <emmintrin.h>通过以下方式：
#include "sse2neon.h"然后跑：
pip install .注意，此解决方案不适用于较新的python版本。我使用python3.8作为这个解决方案。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/68839809
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