如何使用Python读取.gdf文件
如何使用Python读取.gdf文件
提问于 2021-01-18 11:06:49
我的工作是脑电信号数据存储在一个".gdf“文件，为我的大学项目。我的目标是使用Python打开该文件。到目前为止，我可以使用MNE软件包打开该文件。守则是：
import os
import numpy as np
import mne
raw=mne.io.read_raw_gdf('1.gdf')
print(raw.info)因此，我得到了：
Extracting EDF parameters from C:\Users\Gamer\Desktop\1.gdf...
GDF file detected
Setting channel info structure...
Creating raw.info structure...
<Info | 7 non-empty values
bads: []
ch_names: AFz, F3, F1, Fz, F2, F4, FFC5h, FFC3h, FFC1h, FFC2h, FFC4h, ...
chs: 64 EEG
custom_ref_applied: False
highpass: 0.0 Hz
lowpass: 128.0 Hz
meas_date: 2017-04-04 12:50:01 UTC
nchan: 64
projs: []
sfreq: 256.0 Hz
>现在，我的问题是：
- 如何获得表格形式的值？
- 如何使用Python知道数据集的维度？
- 有没有任何方法将.gdf文件转换为.csv文件或任何其他格式(比如熊猫数据格式)？
数据集描述可在v1-1.pdf上获得
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2021-01-18 20:16:03
欢迎来到堆栈溢出和mne-python！:)
如何使用Python知道数据集的维度？
如果您试图打印已经读取的原始文件(而不仅仅是它的info属性)，您应该能够看到维度。原始文件总是存储在mne通道中-首先，因此数据数组的尺寸是channels x samples。
如何获得表格形式的值？
如果您对数组很满意，可以通过.get_data()方法(看这里的医生)获得它。如果你喜欢熊猫的数据，你可以通过raw.to_data_frame() (文档)获得它。
但是在获得数据数组/表之前，您可能需要执行筛选(例如raw.filter(1, None))、注释坏数据段(教程)、内插坏通道(教程)和执行ICA (教程)。通常，您要进行的分析可能是用mne实现的，或者更容易使用mne对象执行。
确保在mne文档中看到了许多丰富的教程和示例。如果您还有任何进一步的问题，我们现在使用语篇：https://mne.discourse.group/
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/65773328
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