问如何安装snakemake 4.3.X？

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根据您的用例，不应该安装Anaconda。相反，遵循生物的推荐 (承载snakemake包的存储库)并安装米尼康达。

接下来，设置您的频道优先级：

conda config --add channels defaults
conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge

更新基 Conda

conda update -n base conda

然后为所需的Snakemake版本创建一个新的环境：

conda create -n snakemake_4_3_1 snakemake=4.3.1

通常，尽量不使用基环境(除了更新conda之外)，并且每当您需要用于特定任务或项目的东西时，为它创建一个新的环境。

您可能会因为与附带anaconda安装的预装模块的版本冲突而获得旧版本的snakemake。您使用的anaconda安装程序相当老(2年)，因此您可能应该尝试使用更新版本。

不过，这并不一定能奏效。它不是关于conda的版本，而是关于base中预先安装的模块。anaconda基env中的依赖关系可能很棘手。最好的解决方案是简单地创建一个具有您需要的规范的环境：

conda create -n smake -c bioconda snakemake=4.3.1
conda activate smake

只是FYI有许多较新的版本，我们目前在5.30.1。无论如何，你应该使用：

conda install -c bioconda snakemake=4.3.1

但最好是创造一个新的环境。

有关如何安装不同环境的更多信息，请查看conda:管理环境。您可能还必须将添加 conda-forge作为一个通道：

conda config --add channels bioconda
conda config --add channels conda-forge