如何将分子储存在记忆中？
如何将分子储存在记忆中？
提问于 2010-08-23 17:34:57
我想把分子储存在记忆里。这些分子可以是简单的分子：
Methane (CH4)
C-H bond-length: 108.7 pm
H-H angle: 109 degrees但也有更复杂的分子，如对乙酰氨基酚(C8H9NO2)：
我如何将分子储存在记忆中，包括所有键长和角度？
将原子结构存储在数组中的好主意？还是有更好的方法？
回答 5
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2010-08-23 17:38:51
它看起来像是某种图形数据结构：
- 一个分子有一组原子
- 原子通过键连接：
- 一个键可以是双键、单键或三重键。
- 键有长度
- 一个键有一个角度
- 这是一个循环图(例如，问题中的例子有一个交替的单键和双键环)
- 这不是一个有向图(如果两个原子结合在一起，那么从哪一端接近键并不重要)
通常，您会将图存储为节点数组(原子)和边缘数组(键)。节点和边缘都是指向结构的指针。
节点(原子)将存储元素。
边界(键)将存储以下字段：
- 指向节点的一对指针
- 债券类型(双/单)
- 键长和角
因为它不是有向图，所以你的数据结构会认为A和B之间的边等价于B和A之间的边，也就是说，对于给定的一对原子，你会期望你的边阵列包含从A到B的边，而不是从B到A的边。
Stack Overflow用户
发布于 2010-08-23 17:40:49
假设您正在对链接结构进行建模，那么链接数据结构似乎是最合适的表示形式。不过，恐怕我还没有足够的化学家来猜测每一件物品都有兴趣存储的数据。
不经意间，这听起来很像一个稍微修改过的版本，你通常是如何存储一个图表--节点和链接，每一个都有相关的数据。在图中，与链接相关的典型数据是链接的“成本”，但在这种情况下，它听起来像是存储了一个向量(角度和长度)。
Stack Overflow用户
发布于 2010-08-23 17:40:52
也许你应该看看布拉德·拉森( Brad )的分子，这是一个非常不错的iPhone/iPod/iPad开源应用程序，它激励了很多程序员。我猜他用了一种标准的分子数据格式来激发你的灵感
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/3550114
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