R包中的rJava类路径.在某些系统上工作..。不是其他人
我为R构建了一个包，它将R封装在一些Java类中。在我的开发膝上型电脑(Ubuntu)上，这个包正确地加载并且工作得很好。在另外两台机器(一台Ubuntu，一台Debian)上，我尝试使用这个包，而且.jpackage()调用没有设置类路径。
这三台机器都运行着R2.12.1和rJava 8.8-8，我认为这是最新的。
整个包是谷歌代码，但是这里是zzz.R文件的内容，它可以在一台机器上设置类路径，而不是其他机器：
##' @import rJava
.onLoad <- function(lib, pkg) {
pathToSdk <- paste(system.file(package = "GSRadR") , "/gsrad_sample/lib/", sep="")
jarPaths <- c(paste(pathToSdk, "clima_core-1.0.0.jar", sep=""),
paste(pathToSdk, "clima_GSRAD-1.0.0.jar", sep=""),
paste(pathToSdk, "colt-1.0.jar", sep=""),
paste(pathToSdk, "commons-lang-2.0.jar", sep=""),
paste(pathToSdk, "junit-3.8.1.jar", sep=""),
paste(pathToSdk, "log4j-1.2.8.jar", sep=""),
paste(pathToSdk, "xqore.jar", sep="")
)
.jpackage(pkg, morePaths=jarPaths)
attach( javaImport( c("java.lang", "java.io")))
packageStartupMessage( paste( "GSRadR loaded. The classpath is: ", paste(.jclassPath(), collapse=" " ) ) )
}在我的笔记本电脑上，它返回以下内容：
> require(GSRadR)
Loading required package: GSRadR
Loading required package: rJava
GSRadR loaded. The classpath is: /home/jal/R/library/rJava/java /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_core-1.0.0.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_GSRAD-1.0.0.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/colt-1.0.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/commons-lang-2.0.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/junit-3.8.1.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/log4j-1.2.8.jar /home/jal/R/library/GSRadR/gsrad_sample/lib/xqore.jar但在我的其他机器上，它只返回：
> require(GSRadR)
Loading required package: GSRadR
Loading required package: rJava
GSRadR loaded. The classpath is: /usr/lib/R/site-library/rJava/java有什么提示可以使.jpackage()调用在不同的机器上以不同的方式工作呢？我以前使用rJava构建过包，并且对.onLoad()函数使用了相同的模板，没有任何问题。
编辑
因此，在其中一台机器上，这是不工作的，我试图简单地添加一个路径到类路径的“非包”方式。但失败了：
> .jaddClassPath("/home/jal/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_core-1.0.0.jar")
> .jclassPath()
[1] "/usr/lib/R/site-library/rJava/java"嗯..。所以我不能在类路径中添加任何内容。但是为什么呢？
编辑II
当我将自定义库加载到一台无法工作的机器上时，我使用的是一个临时库位置，如下所示：
install.packages("/tmp/GSRadR_0.01.tar.gz", lib=/my/path)然后像这样加载库：
require(GARadR, lib=/my/path)通过反复试验，我发现，如果删除lib=位，它就会正常工作。那么，为什么将使用rJava的R包加载到自定义库位置会使.jaddClassPath()函数无法工作呢？
我也许能解决这个问题，但我很想知道是什么导致了这种奇怪的行为(至少对我来说是这样)。
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2011-07-29 02:36:34
我怀疑第一个编辑中的目录或文件不存在：/home/jal/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_core-1.0.0.jar。(另外，您确定要添加特定的文件或目录吗？)
试试file.info("/home/jal/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.12/GSRadR/gsrad_sample/lib/clima_core-1.0.0.jar")。
在我的例子中，我尝试了.jaddClassPath("/willy/wonka")，但它没有起作用。但是当我尝试.jaddClassPath("/home/voldemort")的时候，它成功了。(让Java成为您的魂器。)
https://stackoverflow.com/questions/5097041
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