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社区首页 >问答首页 >关于scipy.cluster.hierarchy.fcluster的返回值和用法

关于scipy.cluster.hierarchy.fcluster的返回值和用法
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Stack Overflow用户
提问于 2013-11-15 22:20:09
回答 1查看 2.8K关注 0票数 2

假设我们有四个观察结果,scipy.cluster.hierarchy.linkage的返回值是:

代码语言:javascript
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[[ 1.          3.          0.08        2.        ]
 [ 2.          4.          0.28813559  3.        ]
 [ 0.          5.          1.          4.        ]]

这个返回值意味着:首先将观察1和3合并到新的集群4中,然后将观察2添加到这个新的集群中,形成一个仍然是新的集群5。最后,观察0被聚类。因为我想得到两个簇{ 1,3,2}和{0},所以我期望返回值为2,1,1,1,这意味着元素0属于集群2,其余的被分组到另一个集群1中,使用阈值0.4。但是实际上scipy.cluster.hierarchy.fcluster返回3 , 1,2,1。当然,我可以编写python代码来分析链接返回的二维数组,但是我认为如果我将阈值设置为0.4,f群集函数可以返回我想要的结果。但是,我不知道如何为它提供参数,所以我想知道您是否可以提供一些示例代码来使用linkage进行分层聚类,并给出使用fcluster进行分层聚类的最终结果,并将观察分组在一个由集合表示的集群中。谢谢。

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回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2013-12-01 13:25:04

fclusterinconsistent作为标准参数供标准选择。以distance为参数,取连接矩阵Z[:,2]的对应距离。如果您想要指定集群的数量,可以只使用maxclust作为标准。如果您使用单个链接进行聚类,则可能有些集群是单个的(离群点)。帮助(f群集)提供了关于如何使用该函数的所需信息,文档也是如此。

票数 5
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/20011627

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