ADBException在使用WebEnv & QueryKey示例用于EFetch中的应用
我使用了来自WebEnv & QueryKey示例的示例代码-- ESearch部分似乎工作得很好，但EFetch却不行。我添加了命令"e.printStackTrace()“以获得完整的错误消息：
WebEnv: NCID_1_160921978_130.14.18.34_9001_1392822285_1227953195
QueryKey: 1
org.apache.axis2.AxisFault: org.apache.axis2.databinding.ADBException: Unexpected subelement {http://www.ncbi.nlm.nih.gov/soap/eutils/efetch_pubmed}Affiliation
org.apache.axis2.AxisFault: org.apache.axis2.databinding.ADBException: Unexpected subelement {http://www.ncbi.nlm.nih.gov/soap/eutils/efetch_pubmed}Affiliation
at org.apache.axis2.AxisFault.makeFault(AxisFault.java:430)
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub.fromOM(EFetchPubmedServiceStub.java)
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub.run_eFetch(EFetchPubmedServiceStub.java:190)
at preparation.Client.main(Client.java:39)
Caused by: java.lang.Exception: org.apache.axis2.databinding.ADBException: Unexpected subelement {http://www.ncbi.nlm.nih.gov/soap/eutils/efetch_pubmed}Affiliation
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub$AuthorType$Factory.parse(EFetchPubmedServiceStub.java:47561)
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub$AuthorListType$Factory.parse(EFetchPubmedServiceStub.java:12284)
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub$ArticleType$Factory.parse(EFetchPubmedServiceStub.java)
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub$MedlineCitationType$Factory.parse(EFetchPubmedServiceStub.java:27035)
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub$PubmedArticleType$Factory.parse(EFetchPubmedServiceStub.java:17841)
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub$PubmedArticleSetChoiceE$Factory.parse(EFetchPubmedServiceStub.java)
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub$PubmedArticleSet_type0$Factory.parse(EFetchPubmedServiceStub.java:54143)
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub$EFetchResult$Factory.parse(EFetchPubmedServiceStub.java:48494)
... 3 more
Caused by: org.apache.axis2.databinding.ADBException: Unexpected subelement {http://www.ncbi.nlm.nih.gov/soap/eutils/efetch_pubmed}Affiliation
at gov.nih.nlm.ncbi.www.soap.eutils.EFetchPubmedServiceStub$AuthorType$Factory.parse(EFetchPubmedServiceStub.java:47555)
... 10 more 我使用Eclipse (版本: 3.7.2)和Ubuntu12.04LTS以及java-7-OpenJDK-AMD 64作为JRE。NCBI页面提到在运行Client.java之前使用此命令：
wsdl2java -uri http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/soap/v2.0/efetch_pubmed.wsdl相反，我只是在控制台中包含了作为输出显示的jar文件(仅包括二进制文件)，因为这对于http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK55696/上的所有其他exapmles ( ELink示例除外)都很好：
org.apache.axis2.AxisFault: org.apache.axis2.databinding.ADBException: Unexpected subelement {http://www.ncbi.nlm.nih.gov/soap/eutils/elink}error 我将描述在我的项目中包含了哪些jar文件。
由于上面提到的页面上下载eutils_axis2.jar的FTP链接不起作用，所以我搜索当前路径并将其添加到我的Eclipse中。
他们的自述文件说，应该使用JDK版本7.0.45和Axis2版本1.6.2，并于2013年12月发布。
我在Google中搜索“下载wsdl2java.sh”以获得与WSDL相关的Axis2版本，并找到了axis2-eclipse-service-plugin-1.6.2.zip包。我下载了这个包并将所有jar文件添加到我的项目中：
apache-mime4j-core-0.7.2.jar
axiom-api-1.2.13.jar
axiom-impl-1.2.13.jar
axis2-adb-1.6.2.jar
axis2-codegen-1.6.2.jar
axis2-kernel-1.6.2.jar
commons-codec-1.3.jar
commons-fileupload-1.2.jar
commons-httpclient-3.1.jar
geronimo-jta_1.1_spec-1.1.jar
geronimo-ws-metadata_2.0_spec-1.1.2.jar
jaxen-1.1.1.jar
jsr311-api-1.0.jar
neethi-3.0.2.jar
servlet-api-2.3.jar
woden-api-1.0M9.jar
woden-impl-commons-1.0M9.jar
woden-impl-dom-1.0M9.jar
wsdl4j-1.6.2.jar
XmlSchema-1.4.7.jar 然后，我在包中搜索剩余的错误消息：
axis2-transport-http-1.6.2.jar
axis2-transport-local-1.6.2.jar
commons-logging-1.1.3.jar
geronimo-javamail_1.4_spec-1.7.1.jar
httpcore-4.3.2.jar 我在谷歌搜索了类似的案例，但没有找到解决方案。我怎样才能修复开头提到的这个消息？
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2014-02-20 16:31:03
NCBI教程中提到的相应的wsdl文件来自2010年。也许它已经过时了，但是首先，请确保创建指定的java类很好。以下步骤是否会导致错误？
下载并解压axis2-1.6.2。
设置环境变量
export AXIS2_HOME=<path/to/axis2-1.6.2>
export JAVA_HOME=<path/to/java-7-openjdk-amd64>下载下列文件
http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/soap/v2.0/efetch_pubmed.xsd
http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/soap/v2.0/efetch_db_pubmed.xsd
http://eutils.ncbi.nlm.nih.gov/soap/v2.0/efetch_pubmed.wsdl并使用efetch_pubmed.wsdl文件在axis2-1.6.2目录中执行bin/wsdl2java.sh。
sh wsdl2java.sh -uri <path/to/efetch_pubmed.wsdl>中应该出现两个java类。
src/gov/nih/nlm/ncbi/www/soap/eutils(仍在axis/bin目录中)。在您的Client.java中导入并使用这些文件(指向本教程中的文件名)。
对我来说很好。希望这能有所帮助。
https://stackoverflow.com/questions/21888354
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