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对cpanm提示的自动响应
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Stack Overflow用户
提问于 2014-08-25 13:58:41
回答 1查看 102关注 0票数 1

我正在安装perl模块Bio::DB::Sam

很快,安装程序要求我找到bam.hlibbam.a文件:

代码语言:javascript
运行
复制
--> Working on Bio::DB::Sam
Fetching http://www.cpan.org/authors/id/L/LD/LDS/Bio-SamTools-1.39.tar.gz ... OK
Configuring Bio-SamTools-1.39 ... Please enter the location of the bam.h and compiled libbam.a files: 

我知道这些文件在哪里之前,我想要自动化的过程。类似于:

代码语言:javascript
运行
复制
echo "/Users/al/programs/samtools-0.1.19" | cpanm Bio::DB::Sam

代码语言:javascript
运行
复制
echo "/Users/alice/programs/samtools-0.1.19" | xargs cpanm Bio::DB::Sam

基本上,我想安装这个模块而不与用户进行任何交互。谢谢你的建议。到目前为止,我尝试过的所有东西仍然要求找到这些文件的位置。

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回答 1

Stack Overflow用户

回答已采纳

发布于 2014-08-25 14:03:52

看起来您可以使用SAMTOOLS环境变量来指定位置。请参阅处理模块安装的Build.PL文件。

票数 3
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/25487617

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