我正在安装perl模块Bio::DB::Sam
。
很快,安装程序要求我找到bam.h
和libbam.a
文件:
--> Working on Bio::DB::Sam
Fetching http://www.cpan.org/authors/id/L/LD/LDS/Bio-SamTools-1.39.tar.gz ... OK
Configuring Bio-SamTools-1.39 ... Please enter the location of the bam.h and compiled libbam.a files:
我知道这些文件在哪里之前,我想要自动化的过程。类似于:
echo "/Users/al/programs/samtools-0.1.19" | cpanm Bio::DB::Sam
或
echo "/Users/alice/programs/samtools-0.1.19" | xargs cpanm Bio::DB::Sam
基本上,我想安装这个模块而不与用户进行任何交互。谢谢你的建议。到目前为止,我尝试过的所有东西仍然要求找到这些文件的位置。
发布于 2014-08-25 14:03:52
看起来您可以使用SAMTOOLS
环境变量来指定位置。请参阅处理模块安装的Build.PL文件。
https://stackoverflow.com/questions/25487617
复制相似问题