我正在使用deap符号回归示例中的代码,图形显示得很好,但我希望节点作为圆角矩形展开,以适应文本automatically.(我不想通过尝试和错误来指定节点大小)。我该怎么做?
# show tree
import matplotlib.pyplot as plt
import networkx
nodes, edges, labels = gp.graph(bests[0])
graph = networkx.Graph()
graph.add_nodes_from(nodes)
graph.add_edges_from(edges)
pos = networkx.graphviz_layout(graph, prog="dot")
plt.figure(figsize=(7,7))
networkx.draw_networkx_nodes(graph, pos, node_size=900, node_color="w")
networkx.draw_networkx_edges(graph, pos)
networkx.draw_networkx_labels(graph, pos, labels)
plt.axis("off")
plt.show()发布于 2015-01-10 17:20:15
使用matplotlib和networkx没有一种简单的方法可以做到这一点(当然,有足够的代码是可能的)。Graphviz在标签方面做得非常出色,从networkx到Graphviz处理点格式文件很容易。
还可以看一看https://github.com/chebee7i/nxpd,它可以完全满足您的需要。
发布于 2015-09-05 23:50:23
参数node_size同时接受标量值和向量值。虽然标量使所有节点大小相等,但向量可以帮助您在列表中为每个节点指定单独的值。如果节点ids是字符串,那么下面的策略工作得很好。
只需根据每个节点id的长度将size参数更改为networkx.draw_networkx_nodes中的列表即可。适当选择the_base_size。
networkx.draw_networkx_nodes(graph, pos,
node_size=[len(v) * the_base_size for v in graph.nodes()],
node_color="w")您也可以根据处理标签的情况对此进行调整。
*然而,我不确定当它根据标签大小从列表中选择节点大小时,是否会保留一对一的通信。分享你的成果。我亲自将它用于字符串节点it,并且运行良好。
发布于 2021-04-08 07:37:19
我喜欢@mathfux的解决方案,因为它在有向图中正确地定位了箭头。但是它需要一些调整来解决所提到的对应问题(位置和颜色列表是按布局顺序排列的,而不是节点顺序);也需要处理基于零的列表索引。我还发现,尺寸是按平方定律工作的,而不是线性的。这里有一个改进的颜色版本,使用Kamada葵而不是Spring,这样布局就不会每次都改变。
import pandas as pd
import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx
G = nx.DiGraph()
G.add_edges_from([(0,1), (1, 1), (1, 7), (2, 1), (2, 2), (2, 3),
(2, 6), (3, 5), (4, 3), (5, 4), (5, 8),
(5, 9), (6, 4), (7, 2), (7, 6), (8, 7)])
labelList="zero one twotwotwo three four five six seven eighteighteight nine".split(' ')
positions=nx.kamada_kawai_layout(G)
plt.figure(figsize =(9, 9))
nx.draw_networkx(G,
node_color =['C{}'.format(i) for i in positions],
pos=positions,
labels={idx: val for idx, val in enumerate(labelList)},
node_size=[len(labelList[i])**2 * 60 for i in positions]
)

https://stackoverflow.com/questions/27878794
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