R的插入包中的rfe给出错误为:任务1失败-“参数1不是向量”
R的插入包中的rfe给出错误为:任务1失败-“参数1不是向量”
提问于 2015-06-05 09:38:09
我有一个training_predictors集，其中包含56列，所有这些列都是numeric。training_labels是0和1的factor载体。
我使用下面的列表作为要测试的子集大小。
subset_sizes <- c(1:5, 10, 15, 20, 25)下面是修改后的rfFuncs函数的列表。
rfRFE <- list(summary = defaultSummary,
fit = function(x, y, first, last, ...) {
library(randomForest)
randomForest(x, y, importance = first, ...)
},
pred = function(object, x) predict(object, x),
rank = function(object, x, y) {
vimp <- varImp(object)
vimp <- vimp[order(vimp$Overall, decreasing = TRUE),,drop = FALSE]
vimp$var <- rownames(vimp)
vimp
},
selectSize = pickSizeBest,
selectVar = pickVars)我已宣布管制职能如下：
rfeCtrl <- rfeControl(functions = rfRFE,
method = "cv",
number = 10,
verbose = TRUE)但是当我运行rfe函数时，如下所示，
rfProfile <- rfe(training_predictors,
training_labels,
sizes = subset_sizes,
rfeControl = rfeCtrl)我收到了一个错误，因为：
Error in { : task 1 failed - "argument 1 is not a vector"我也尝试过改变矢量subset_sizes，但仍然没有成功。我做错了什么？
更新:我试着一个一个地运行这些步骤，问题似乎在于rank函数。但我还是想不出这个问题。
更新：我发现了问题。秩函数中的varImp不包含$Overall。但是它包含名为0和1的列。为什么会这样呢？0和1意味着什么(顺便说一句，这两个列值完全相同)？此外，如何使varImp返回$Overall列？作为一种临时解决方案，我正在创建一个新的列$Overall，并将它附加到rank函数中的vimp。
回答 2
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2015-06-09 23:18:01
使用0和1作为因子级别是有问题的，因为它们不是有效的R列名。在另一篇文章中，您可能会收到一条关于将这些信息用作输出的因素级别的消息。
尝试使用具有更多信息级别的因素结果，这些级别可以转换为有效的R列名(用于类概率)。
Stack Overflow用户
发布于 2017-03-08 19:43:22
我已经为这个问题找到了一个解决方案，用插入符号拟合rfe中的logistic回归模型。解决办法如下：
glmFuncs$rank <-function (object, x, y){
vimp <- varImp(object, scale = FALSE)
loadNamespace("dplyr")
vimp <- vimp$importance %>%
mutate(var=row.names(.)) %>%
arrange(-Overall)
vimp <- vimp[order(vimp$Overall, decreasing = TRUE), ,drop = FALSE]
vimp
}页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/30663205
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