如何并行运行DEoptim？
如何并行运行DEoptim？
提问于 2015-06-16 12:19:22
在R语言中开发了一个具有8个参数的水文模型，并利用DEoptim对模型进行了标定。由于运行每个函数所需的时间长度，我想并行化DEoptim函数，因为它有一个并行运行的选项。文件表明，这一情况如下：
DEctrl <- DEoptim.control(trace=TRUE,parallelType=1,packages=c(),parVar=c())
ans <- DEoptim(Calibrate,lower,upper,DEctrl)如果我在没有并行化的情况下运行DEoptim，那么它可以正常工作，但是如果我将parallelType设置为1，则会失败，但会出现以下错误：
Error in checkForRemoteErrors(val) :
8 nodes produced errors; first error: could not find function "startyear"我想这是因为我没有在parVar和packages中设置DEoptim.control，但我不太明白他们要求什么。我想packages是我预先加载的库模块，但不确定parVar是什么。文档说，parVar是一个变量名(作为字符串)的列表，这些变量名称需要存在于环境中，以供目标函数使用或被目标函数用作参数。
我的代码有1500行长，所以我不确定应该包括哪些变量名。代码是一系列子函数--以下是其中的一部分：
library(DEoptim)
library(package = "hydromad")
library(maptools)
library(compiler)
#enableJIT(3)
library(tcltk)
library(raster)
Calibrate <- function(x) {
cmax <<- x[1]
Cr <<- x[2]
Cl <<- x[3]
Crb <<- x[4]
Clb <<- x[5]
returnflowriver <<- x[6]
returnflowland <<- x[7]
kd <<- x[8]
startyear()
-RSquaredboxcox
}
initialisemodel <- function() {
S1 <<- Sys.time()
# 1 Yangtze watershed inputs
# Load librarys
Starttime <- Sys.time()
Catchmentnum <- 1
# Set global parameters
Plothourlyrunoffswitch <- 0
cmin <<- 0.01
tempmelt <<- 1.5
tempsnow <<- 0.0
temprain <<- 1.5
DDFSnow <<- 4.1
DDFIce <<- 7.1
shiftcell <<- Resolution/3600
projstring <<- "+proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs"诸若此类。
所以我的问题是，我应该在parVar和packages中包括什么？
回答 1
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2015-06-16 12:32:12
正如您在问题中提到的，您需要使用parVar和packages。
packages向量应该列出您使用的任何包，例如使用在另一个包中找到的随机数生成器。
parVar向量应该包含在代码调用的函数或变量中。所以在你的情况下
parVar = "startyear"我强烈怀疑，这将引发另一个关于另一个缺少变量的错误(您应该将该变量添加到parVar并重复该过程)。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/30867402
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