问扩展cmd进程中的下一个流程
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Stack Overflow用户

提问于 2020-12-22 02:28:19

回答 1查看 29关注 0票数 1

我刚刚为nextflow创建了一个新环境，但是当我运行脚本时，流程步骤展开如下：

[warm up] executor > local
[9c/f50613] Submitted process > bowtie2_target_genome (2)
[1f/1b1f43] Submitted process > bowtie2_vector (1)
[d0/4b99a5] Submitted process > bowtie2_vector (3)
[ef/183556] Submitted process > bowtie2_target_genome (1)
[4a/330246] Submitted process > bowtie2_target_genome (4)
[0b/1e00ff] Submitted process > bowtie2_vector (4)
[bd/ad292b] Submitted process > bowtie2_vector (2)
[98/1caa92] Submitted process > bowtie2_vector (5)
[55/2f25bb] Submitted process > bowtie2_target_genome (5)
[05/5890e2] Submitted process > bowtie2_target_genome (3)

它曾经是这样的：

executor >  local (1)
[14/0418b6] process > bowtie2_target_genome (3)      [100%] 5 of 5
[a3/7b824b] process > bowtie2_vector (1)             [100%] 5 of 5
[fc/1b8883] process > aln_sum (5)                    [100%] 5 of 5
[57/0762c0] process > create_bedgraph_and_bigwig (2) [100%] 5 of 5

nextflow

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2020-12-22 10:04:15

看起来你已经在你的运行命令中添加了-ansi-log false。此选项的默认值为'true'，因此要么使用该选项，要么完全删除该选项。

在非交互式shell中运行Nextflow时，设置-ansi-log false非常有用。您的命令行可能如下所示：

nextflow run -ansi-log false main.nf

票数 0

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原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/65398109

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