将针织品集成到您的工作流中
将针织品集成到您的工作流中
提问于 2015-07-15 19:36:22
只是想知道，人们如何将针织品融入到他们当前的工作流程中？我有一个长的、预先存在的.R文件，用于读取数据、进行分析，并且在文件的末尾，例如，我生成了一个ggplot和一个总结我的发现的表格。我想将这些内容合并到文档中，无论是减价还是LaTeX。我是否应该将初始的.R文件重命名为.Rmd文件，并将编织机命令放在接近尾端的位置？我是否应该创建一个新的.Rmd文件来创建报告，并以某种方式合并来自.R文件的分析？换句话说，在我现有的工作流中添加针织品输出的最佳实践是什么？
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发布于 2015-07-15 20:20:09
您应该使用外部资源将脚本保存为代码存储库，并使用您的编织品文档来调用它。您将从这种方法中受益。
例如，在长.R脚本中标记现有代码，如下所示：
## @knitr Q5
all your data prep code
plotQ5 <- ggplot(your plot code
plotQ5然后，在带有.Rnw后缀的针织文档中，有类似于以下代码块的内容
<<Q05, results='hide', echo = FALSE, include=FALSE>>=
@
<<Q05plot, fig.width=width, fig.height=height, fig.align="center", warning = FALSE, echo=FALSE>>=
plotQ05
@现在，当您为Latex编织品编译PDF时，您将从脚本中获取代码和绘图，并输出包含该脚本的PDF文件。
另外，学习在针织品中缓存大对象，这样如果它们没有改变，就不需要再读取它们。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/31439523
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