如何利用光学提取簇(R包- dbscan，或替代品)
如何利用光学提取簇(R包- dbscan，或替代品)
提问于 2015-11-13 18:29:08
这可能是R问题和算法问题的混合。问题既涉及光学的一般问题，也涉及光学在包"dbscan“( https://cran.r-project.org/web/packages/dbscan/dbscan.pdf )中的R实现问题。
我从使用DBSCAN到光学的主要原因是我拥有的数据集有可变密度的团簇，并且它们是不规则形状的。光学产生一个可达性图，但对于我的用例来说，更有趣的部分是星系团的提取。在最初的论文中，有一些自动的聚类提取，这不仅仅是eps的一个切点。( http://fogo.dbs.ifi.lmu.de/Publikationen/Papers/OPTICS.pdf)。
那么，我的两个部分qn: 1)有没有一种方法来使用R包进行自动提取? 2)是否有一个光学实现支持这一点(python，其他地方)？
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2018-02-21 17:40:24
1)是的！dbscan软件包具有提取变密度光团簇的功能。?dbscan::extractXi()
extractXi基于可达性图的陡度，在Ankerst等人(1999年)中对簇进行了精确的提取。xi参数的一种解释是，它根据相对簇密度的变化对簇进行分类。使用的算法最初是由ELKI框架贡献的，但是包含了一组修复程序。
有关方法和示例的详细说明，请参见https://cran.r-project.org/web/packages/dbscan/vignettes/dbscan.pdf。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/33699514
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