我有一只熊猫DataFrame,看上去如下所示:
Time Measurement
0 0 1
1 1 2
2 2 3
3 3 4
4 4 5
5 0 2
6 1 3
7 2 4
8 3 5
9 4 6
10 0 3
11 1 4
12 2 5
13 3 6
14 4 7
15 0 1
16 1 2
17 2 3
18 3 4
19 4 5
20 0 2
21 1 3
22 2 4
23 3 5
24 4 6
25 0 3
26 1 4
27 2 5
28 3 6
29 4 7它可以使用以下代码生成:
import pandas
time=[0,1,2,3,4]
repeat_1_conc_1=[1,2,3,4,5]
repeat_1_conc_2=[2,3,4,5,6]
repeat_1_conc_3=[3,4,5,6,7]
d1=pandas.DataFrame([time,repeat_1_conc_1]).transpose()
d2=pandas.DataFrame([time,repeat_1_conc_2]).transpose()
d3=pandas.DataFrame([time,repeat_1_conc_3]).transpose()
repeat_2_conc_1=[1,2,3,4,5]
repeat_2_conc_2=[2,3,4,5,6]
repeat_2_conc_3=[3,4,5,6,7]
d4=pandas.DataFrame([time,repeat_2_conc_1]).transpose()
d5=pandas.DataFrame([time,repeat_2_conc_2]).transpose()
d6=pandas.DataFrame([time,repeat_2_conc_3]).transpose()
df= pandas.concat([d1,d2,d3,d4,d5,d6]).reset_index()
df.drop('index',axis=1,inplace=True)
df.columns=['Time','Measurement']
print df如果你看一下代码,你会发现我在同一个DataFrame中有两个实验重复,应该在df.iloc[:15]中分开。此外,在每个实验中,我有3个可以被认为类似剂量响应的起始条件的子实验,即第一次实验从1开始,第二次以2开始,第三次以3开始。这些实验应该以“`len(Time)”的指数间隔来分离,即每一次实验重复的0-4,5个元素。有谁能告诉我,在每个实验中,把这些数据分成单独的时间过程测量的最佳方法是什么?我不太清楚什么是最好的数据结构,但我只需要能够访问每个子实验的每个子实验的每一个实验重复容易。也许有时候是这样的:
repeat1=
Time Measurement
0 0 1
1 1 2
2 2 3
3 3 4
4 4 5
5 0 2
6 1 3
7 2 4
8 3 5
9 4 6
10 0 3
11 1 4
12 2 5
13 3 6
14 4 7
Repeat 2=
Time Measurement
15 0 1
16 1 2
17 2 3
18 3 4
19 4 5
20 0 2
21 1 3
22 2 4
23 3 5
24 4 6
25 0 3
26 1 4
27 2 5
28 3 6
29 4 7发布于 2016-06-11 10:40:15
IIUC,您可以设置一个多索引,以便可以轻松地索引您的DF访问实验和子实验:
In [261]: dfi = df.set_index([df.index//15+1, df.index//5 - df.index//15*3 + 1])
In [262]: dfi
Out[262]:
Time Measurement
1 1 0 1
1 1 2
1 2 3
1 3 4
1 4 5
2 0 2
2 1 3
2 2 4
2 3 5
2 4 6
3 0 3
3 1 4
3 2 5
3 3 6
3 4 7
2 1 0 1
1 1 2
1 2 3
1 3 4
1 4 5
2 0 2
2 1 3
2 2 4
2 3 5
2 4 6
3 0 3
3 1 4
3 2 5
3 3 6
3 4 7选择子实验
In [263]: dfi.loc[1,1]
Out[263]:
Time Measurement
1 1 0 1
1 1 2
1 2 3
1 3 4
1 4 5
In [264]: dfi.loc[2,2]
Out[264]:
Time Measurement
2 2 0 2
2 1 3
2 2 4
2 3 5
2 4 6选择第二个实验和所有的子实验:
In [266]: dfi.loc[2,:]
Out[266]:
Time Measurement
1 0 1
1 1 2
1 2 3
1 3 4
1 4 5
2 0 2
2 1 3
2 2 4
2 3 5
2 4 6
3 0 3
3 1 4
3 2 5
3 3 6
3 4 7或者,您也可以创建自己的切片功能:
def my_slice(rep=1, subexp=1):
rep -= 1
subexp -= 1
return df.ix[rep*15 + subexp*5 : rep*15 + subexp*5 + 4, :]演示:
In [174]: my_slice(1,1)
Out[174]:
Time Measurement
0 0 1
1 1 2
2 2 3
3 3 4
4 4 5
In [175]: my_slice(2,1)
Out[175]:
Time Measurement
15 0 1
16 1 2
17 2 3
18 3 4
19 4 5
In [176]: my_slice(2,2)
Out[176]:
Time Measurement
20 0 2
21 1 3
22 2 4
23 3 5
24 4 6PS更方便地连接DFs:
df = pandas.concat([d1,d2,d3,d4,d5,d6], ignore_index=True)所以您不需要下面的.reset_index()和drop()
https://stackoverflow.com/questions/37762372
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