如何设置与RStudio一起使用的conda安装R？
我一直在尝试使用conda (最终与Beaker笔记本一起使用)来设置我的conda，并且我希望能够在安装了conda的R版本中使用RStudio。
我安装R的方法
conda install -c r r
conda install -c r r-essentials
conda install -c r r-rserve
conda install -c r r-devtools
conda install -c r r-rcurl
conda install -c r r-RJSONIO
conda install -c r r-jpeg
conda install -c r r-png
conda install -c r r-roxygen2
conda install --channel https://conda.anaconda.org/bioconda bioconductor-edger我运行了那个版本的R(我只安装了这个版本)
> version
_
platform x86_64-apple-darwin11.0.0
arch x86_64
os darwin11.0.0
system x86_64, darwin11.0.0
status
major 3
minor 3.1
year 2016
month 06
day 21
svn rev 70800
language R
version.string R version 3.3.1 (2016-06-21)
nickname Bug in Your Hair 在R中运行Jupyter是一种小问题。例如，当它输出错误时，它会输出到stdout，并用一个换行符来拆分字符串中的每个字符。我想使用RStudio，但我不想安装另一个版本的R。
如何将我的conda版本的R 路由到RStudio?
下面是我的.bash_profile不确定这是否有用：
$ cat ~/.bash_profile
# added by Anaconda3 4.0.0 installer
export PATH="/Users/jespinoz/anaconda/bin:$PATH"
export RSTUDIO_WHICH_R=/Users/jespinoz/anaconda/bin/R 我一直在努力学习这些教程，但我迷失了方向。我真的不太熟悉环境变量之类的东西。
(1) https://support.rstudio.com/hc/en-us/community/posts/207830688-Using-RStudio-with-conda
(2) Launch mac eclipse with environment variables set
当我寻找我的R时，它告诉我：
$ which R
/Users/jespinoz/anaconda/bin/R但是，来自(1)的方向是使用这个路径，这是非常令人困惑的：
/Users/jespinoz/anaconda/lib/R/bin/R我试着做这个家伙做的事情，并把它添加到我的.bash_profile中，但是它没有起作用。我甚至制作了一个.bashrc，但它仍然不起作用(我在添加了行之后，两者都是sourced )
export RSTUDIO_WHICH_R=/Users/jespinoz/anaconda/bin/R
How to tell RStudio to use R version from Anaconda
不幸的是，anaconda在integration中没有这方面的教程。
回答 6
Stack Overflow用户
发布于 2017-02-15 20:00:41
Stack Overflow用户
发布于 2016-08-20 16:39:22
更新:把这个添加到~/.bash_profile！
export RSTUDIO_WHICH_R="/Users/jespinoz/anaconda/bin/R"
launchctl setenv RSTUDIO_WHICH_R $RSTUDIO_WHICH_R@ Credits的最后一行https://github.com/conda/conda/issues/3316#issuecomment-241246755的学分
上面雷·唐纳利说的话的补充。基本上，它必须在正确的环境中执行(即从终端运行它)。
你也可以：
(A)将其放入您的~/.bash_profile export RSTUDIO_WHICH_R=/Users/[yourusername]/anaconda/bin/R中(如果您使用的是conda，但您可以放置任何R路径)
(B)然后在终端被源后(重新启动终端或执行source .bash_profile)：应该工作的open -a RStudio中输入它。
或者你可以做我做的事：
(A)打开automator (如果您不在mac上，很抱歉，这只会在mac上工作)
(B)使用Run Shell Script
(C)删除已经存在的cat并放入：export RSTUDIO_WHICH_R=/Users/[yourusername]/anaconda/bin/R open -a RStudio
(D)将它保存为类似于run_rstudio.app的东西，然后运行它，它应该可以工作：
Stack Overflow用户
发布于 2020-07-05 05:28:04
从激活的Conda环境启动RStudio
至少对于Mac，我发现在shell会话中激活环境，然后启动RStudio就足够了。
$ conda activate my_r_env
$ /Applications/RStudio.app/Contents/MacOS/RStudio一旦进入R，就可以验证R.home()和.libPaths()的值指向特定于环境的位置。
这里的优点是，您没有固定在环境变量中最后设置的内容，例如通过.bash_profile。相反，您可以拥有许多基于R的环境，并在它们之间切换(或者同时运行多个环境)，而不会篡改全局设置。
为方便起见建议的别名
也许我建议的唯一全局设置是将rstudio的别名添加到您的.bash_profile中，这样您就不必每次都键入完整的路径，例如
alias rstudio='/Applications/RStudio.app/Contents/MacOS/RStudio &'这使得我们能够做到
$ conda activate my_r_env
$ rstudio
$其中，&使您能够继续使用或关闭shell，而不会影响RStudio实例。
https://stackoverflow.com/questions/38534383
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