Matlab中不适用于火山图的标签
Matlab中不适用于火山图的标签
提问于 2017-10-03 20:51:33
我是一个完整的MATLAB新手，我的第一个任务是创建一个火山图。我一直在使用文献资料来了解它并开始工作。
我正在使用下面的虚拟数据来开始-
Fer1l6 0 0.116815 3.39E-07
Selenoo 0.231255 2.104358 3.17E-06
Myh9 0 0 3.52E-05
SCARNA8 0 0 5.90E-05
7SK 0.4105501 1.593424 7.53E-05
Cnksr1 0.2652796 0.276202 0.000142596
Kcng3 0 0.947934 0.0003170
Acaa1b 0.97177 2.25452 0.0003906
adsf 0.44 0.35 0.3这里，第一列代表gene_name，第二列代表条件1，第三列代表基因表达值，第三列代表条件2，最后一列代表P-值。我将这些数据保存在Excel文件中。
现在，为了创建火山图，我编写了以下代码-
filename='quant_data_for_volcano.xlsx';
youngdata=xlsread(filename,'B:B')
olddata=xlsread(filename,'A:A')
pvalues=xlsread(filename,'C:C')
gene_labels=xlsread(filename,'D:D')
SigStructure = mavolcanoplot(youngdata, olddata, pvalues, 'LogTrans', true, 'Labels', gene_labels)我的理解是，“标签”论点采用了各种基因的标签(本例中为gene_names)。然而，当我运行这段代码时，它并没有给我图形用户界面中的gene_name标签，而是给出了作为基因标签的行号--，这是当我不提供任何标签时应该做的事情！！
我已经将输出GUI作为图片附加-正如您可以看到的那样，基因的标签只是数字(与行号相对应)。
手册上说标签应该是一个单元阵列，‘我不确定这是否重要，如果是，那么如何实现它。任何帮助都是很好的！
回答 1
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2017-10-04 00:25:29
由于您已经知道mavolcanoplot()需要一个单元阵列，所以您希望xlsread()返回一个单元格数组，而不是一个矩阵：
[num, gene_labels]=xlsread(filename,'D:D') % (num is a matrix while gene_labels is a cell array)页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/46553217
复制相关文章
相似问题
腾讯云开发者
