无法让Biparite包中的“plotweb”工作(注册商标)
无法让Biparite包中的“plotweb”工作(注册商标)
提问于 2017-12-10 12:40:43
我试图使用R中的biparite包来可视化一个双向网络，我的数据由电子表格中的4列组成。列包含
1)植物名称
2)蜜蜂种名
3)场地
4)相互作用频率。
我首先将数据从CSV文件中读取到R中，然后使用辅助函数frame2webs将其转换为web。然后，当我尝试用plotweb()可视化网络时，我会得到错误消息：
在webrind，cind，drop = FALSE中的错误:不正确的尺寸数
我的代码如下所示：
library(bipartite)
bee <- read.csv('TestFile.csv')
bees <- as.data.frame(bee)
BeeWeb <- frame2webs(bees, type.out = "array")
plotweb(BeeWeb)我也试过：
BeeWeb <- frame2webs(bees,
varnames = c("higher","lower","webID","freq"),
type.out = "array")请帮帮我！我是R的新手，我正在努力使这件事奏效。干杯!
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2019-05-10 17:36:28
不确定您的数据是什么样子，但当我在“较高”或“较低”列中有一个单一因素级别时，type.out是"list"，而emptylist是真的，则会发生这种情况。
这是由于出现了空值问题，只有当frame2webs为"list“且emptylist为TRUE时，type.out才会调用该函数。“空”使用NROW和NCOL查找数据的维度，它们将一行输入解释为垂直向量。当“较低”或“较高”中只有一个因素级别时，空的输入是一个一行数组。空将该行解释为列，因此出现“不正确的维度数”错误。
有两个简单的解决办法：
- 将type.out设置为“数组”
- 将空列表设置为FALSE
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/47738935
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