使用awk选择列中特定值大于x的行
使用awk选择列中特定值大于x的行
提问于 2020-06-23 14:59:23
我尝试使用awk来选择第三列中值大于98的所有行。在输出中，只有98 -98.99之间的行...被选中，值大于98.99的行未被选中。
我想提取所有值大于98的行，包括99、100等等。
下面是我的代码和输入格式：
for i in *input.file; do awk '$3>98' $i >{i/input./output.}; done
A chr11 98.80 83 1 0 2 84
B chr7 95.45 22 1 0 40 61
C chr7 88.89 27 0 1 46 72
D chr6 100.00 20 0 0 1 20预期输出
A chr11 98.80 83 1 0 2 84
D chr6 100.00 20 0 0 1 20Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2020-06-23 15:33:51
好的，如果您有一系列的文件，*input.file，并且您想要选择那些包含$3 > 98的行，然后将这些值写到相同的前缀，但是使用output.file作为文件名的其余部分，您可以使用：
awk '$3 > 98 {
match (FILENAME,/input.file$/)
print $0 > substr(FILENAME,1,RSTART-1) "output.file"
}' *input.file它使用match查找input.file开头的索引，然后使用substr获取该索引之前的文件名部分，并将"output.file"附加到最终输出文件名的子字符串。
match()将RSTART值设置为当前文件名中input.file开头的索引，然后substr使用该索引截断该索引处的当前文件名。有关完整的详细信息，请参阅GNU awk String Functions。
例如，如果您有输入文件：
$ ls -1 *input.file
v1input.file
v2input.file两者都包含您的示例内容：
$ cat v1input.file
A chr11 98.80 83 1 0 2 84
B chr7 95.45 22 1 0 40 61
C chr7 88.89 27 0 1 46 72
D chr6 100.00 20 0 0 1 20运行上面的awk命令将产生两个输出文件：
$ ls -1 *output.file
v1output.file
v2output.file包含第三个字段大于98的记录
$ cat v1output.file
A chr11 98.80 83 1 0 2 84
D chr6 100.00 20 0 0 1 20页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/62529021
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