问具有多个命令的for循环
EN

Stack Overflow用户

提问于 2019-01-30 18:14:29

回答 1查看 1.9K关注 0票数 0

我在files.txt中有多个文件名。我想在每个文件上运行三个脚本。我的建议对吗？

files.txt：

SRR13143.sra
SRR44234.sra
SRR23424.sra

我的尝试：

for FILE in "file.txt";
do
prefetch --max-size 300G $FILE
fastq-dump --gzip --split-3 $FILE
rm $FILE;
done

回答已采纳

发布于 2019-01-30 18:16:13

相反，您需要一个while循环。

while IFS= read -r FILE; do
  prefetch --max-size 300G "$FILE"
  fastq-dump --gzip --split-3 "$FILE"
  rm "$FILE"
done < file.txt

票数 2

页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持

原文链接：

https://stackoverflow.com/questions/54447005

复制

相似问题

问具有多个命令的for循环EN