如何将新的数据点投影到现有的坐标系中
如何将新的数据点投影到现有的坐标系中
提问于 2019-02-06 14:04:50
我有一份多组学数据清单，其中包括三种基因/蛋白质/细胞的矩阵，以及列中的个体样本。这三个矩阵共享相同的样本。我使用多个CO惯性分析将每个样本投射到CIA空间(每个样本由基于转录、蛋白质模拟和细胞数据的三个点表示)。现在，我在我原来的空间结构中有了一个新的观点，我想把它投射到中央情报局的坐标系中。
我怎么才能得到新的中情局坐标？
为了重现性，我以NCI60数据为例。
library(omicade4)
data(NCI60_4arrays)
NCI60_4arrays.sub <- lapply(NCI60_4arrays, function(m) { return(m[,1:
(ncol(m)-1)])})
mcoin <- mcia(NCI60_4arrays.sub, cia.nf=4)用于提取CIA空间中的样本坐标：
sample.cia.coordinates <- mcoin$mcoa$Tli我怎么能投射一个新的数据点，并得到它的中央情报局坐标？
例如，一个新的数据点：
new.point <- lapply(NCI60_4arrays, function(m) { return(m[,ncol(m)])})回答 1
Stack Overflow用户
回答已采纳
发布于 2019-02-06 15:28:15
当您想要理解分析背后的计算时，一种选择是创建一个低容量的示例分析，例如：
sample <- lapply(NCI60_4arrays[1:2], function(m) { return(m[1:7,1:5])})
sample_mcoa <- mcia(sample, cia.nf = 2)然后试着理解你是如何传递的：
- 2矩阵7x5
至：
- 1矩阵10x2
它可能是几个矩阵产生的，其中一个与sample_mcoa$mcoa$axis。我不知道这是否对你有帮助。
页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/54555479
复制相关文章
相似问题
腾讯云开发者
