问ibdata1文件在mysql中的用途是什么？

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在处理如此复杂的DBMS时，您确实应该仔细研究文档。http://dev.mysql.com/doc/refman/5.1/en/innodb-configuration.html声明：

InnoDB存储引擎管理的两个重要的基于磁盘的资源是表空间数据文件和日志文件。如果没有指定InnoDB配置选项，MySQL将在MySQL数据目录中创建一个自动扩展的名为ibdata1的10 5MB数据文件和两个名为ib_logfile0和ib_logfile1的5MB日志文件。

基本上，ibdata1文件包含InnoDB表的表数据。如果出于性能原因使用不同的存储子系统存储第二个文件，或者如果ibdata1在其原始分区上空间不足，并且希望有一个具有不同存储文件的简单外接存储，则指定多个文件将是有意义的。修复文件大小显然会限制可以存储在InnoDB表中的总数据量。

在您的情况下，ibdata1文件可能是自动增长的，因此当更多的数据被放入InnoDB表中时，它会膨胀。在从InnoDB表中删除记录后，该文件将包含标记为“空闲”的页面，这些页面可用于未来的数据，但文件本身是不可收缩的。如果您删除了大量的数据并需要收缩ibdata1，那么唯一受支持的方法就是使用mysqldump备份表并重新初始化数据库--参见这个StackOverflow的答案获取详细信息。