问使用abs()函数对数据集进行排序

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我正在尝试运行一个基因集富集分析，如下图所示：http://yulab-smu.top/clusterProfiler-book/chapter7.html

我一直在尝试使用这个特定的代码：

data(df, package="DOSE")
gene <- names(df)[abs(df) > 2]
head(gene)

当我运行上面的代码时，我得到了以下错误：

data set ‘df’ not found[1] NA NA NA NA NA NA
[1] FALSE

我正在尝试对Log2FoldChange (从-x到+x的值)的数据集应用截止值1。然后，我想将它和相应的名称(ENTREZ ID)放入一个名为gene的数据框中，这样我就可以运行富集分析了。

如果我指定数据的列：

#Define DEG as LFC>1
data(df, package="DOSE")
gene <- names(df$ENTREZ)[abs(df$log2FoldChange) > 2]
head(gene)

gene <- (abs(1) > 1)
head(gene)

我得到了：

data set ‘df’ not foundNULL
[1] FALSE

上面的'abs()‘函数不起作用(我已经复制并修改了上面的vignette)。

我在这里找到了另一种解释，它可能暗示了一条不同的路线。Ordering multiple columns using cut-off values in R

我是不是错过了一些语法来完成这项工作？任何帮助都将不胜感激。

谢谢