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社区首页 >问答首页 >Biopython已成功安装在anaconda 3中,但模块导入失败

Biopython已成功安装在anaconda 3中,但模块导入失败
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Stack Overflow用户
提问于 2020-06-10 09:01:13
回答 1查看 229关注 0票数 0

以前有人问过这个问题的一个变体,但我不得不问,因为那里给出的解决方案对我不起作用。

我在anaconda 3中使用Jupyter,首先我使用!pip install biopython安装了biopython。它已成功安装,但当我绑定到‘`import’时,它返回了一个ModuleNotFoundError。

后来,我在anaconda提示符中使用了conda install -c anaconda jupyterconda install -c anaconda biopython来安装biopython。它们已成功安装,但仍然存在相同的问题。

但是,如果我输入带有小写b的‘`import bio’,那么模块错误就不会出现。但是,我仍然不能在模块中调用任何函数。下面是我所面临的错误的一个例子。这是我的第一篇文章,所以我没有足够的名气来发布嵌入的图片。我将在这里张贴外部链接。

https://imgur.com/yydzI0y

所以我检查了目录的文件夹名是大写还是小写。它是大写的,所以我想也许应该改成小写,然后我就改了。仍然是同样的问题。

下面是我的路径,它似乎包含了anaconda目录。

https://imgur.com/v7VeC1f

我真的需要使用biopython,所以请帮助我。

EN

回答 1

Stack Overflow用户

发布于 2020-06-10 13:29:47

Bio是正确使用的参考。

尝试此操作:首先,确保包文件夹的名称为Bio,因为这是正确的名称

代码语言:javascript
运行
复制
dir C:\Users\Asus\anaconda3\Lib\site-packages\*io*
...
06/10/2020  01:12 PM    <DIR>          Bio
...

然后尝试以下代码:

代码语言:javascript
运行
复制
import Bio
from Bio.Blast import NCBIWWW

f=open('smn.fasta').read()
result=NCBIWWW.qblast("blastn","nt",f)
票数 0
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页面原文内容由Stack Overflow提供。腾讯云小微IT领域专用引擎提供翻译支持
原文链接:

https://stackoverflow.com/questions/62294230

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