以前有人问过这个问题的一个变体,但我不得不问,因为那里给出的解决方案对我不起作用。
我在anaconda 3中使用Jupyter,首先我使用!pip install biopython
安装了biopython。它已成功安装,但当我绑定到‘`import’时,它返回了一个ModuleNotFoundError。
后来,我在anaconda提示符中使用了conda install -c anaconda jupyter
和conda install -c anaconda biopython
来安装biopython。它们已成功安装,但仍然存在相同的问题。
但是,如果我输入带有小写b的‘`import bio’,那么模块错误就不会出现。但是,我仍然不能在模块中调用任何函数。下面是我所面临的错误的一个例子。这是我的第一篇文章,所以我没有足够的名气来发布嵌入的图片。我将在这里张贴外部链接。
所以我检查了目录的文件夹名是大写还是小写。它是大写的,所以我想也许应该改成小写,然后我就改了。仍然是同样的问题。
下面是我的路径,它似乎包含了anaconda目录。
我真的需要使用biopython,所以请帮助我。
发布于 2020-06-10 13:29:47
Bio是正确使用的参考。
尝试此操作:首先,确保包文件夹的名称为Bio,因为这是正确的名称
dir C:\Users\Asus\anaconda3\Lib\site-packages\*io*
...
06/10/2020 01:12 PM <DIR> Bio
...
然后尝试以下代码:
import Bio
from Bio.Blast import NCBIWWW
f=open('smn.fasta').read()
result=NCBIWWW.qblast("blastn","nt",f)
https://stackoverflow.com/questions/62294230
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