将json有效负载中的带引号的参数传递给shell脚本
将json有效负载中的带引号的参数传递给shell脚本
提问于 2020-06-11 08:27:54
我正在开发一个python脚本，它将参数传递给位于Docker容器中的shell脚本。我正在使用这个Go webhook工具(https://github.com/adnanh/webhook)来实现这一点。到目前为止，我已经成功地通过request模块将简单的参数传递给了我的shell脚本。然而，我遇到了一个障碍。
我的工具的目的是触发一个dna组装程序，该程序有许多可选的参数，可以由用户调整。目前，我已经像这样触发了webhook：
def trigger_assembler(out, assem_opts):
id = "assemble"
payload = {"FWD": f"-f data/{out}/R1.fq", "REV": f"-r data/{out}/R2.fq", "OUT": f"-o {out}",
"OPT": f'-p \" {assem_opts} \"'}
try:
r = requests.post(f"http://0.0.0.0:9000/hooks/{id}", json=payload)
r.raise_for_status()
except requests.exceptions.RequestException as e: # This is the correct syntax
raise SystemExit(e)在shell脚本中，我解析了参数，然后尝试执行以下命令：
nohup Trinity --left "${FWD}" --right "${REV}" "${ASSEM_ARGS}" \
--output data/"${OUT}"/trinity &正如您在示例代码中看到的，我尝试转义双引号。在阅读了其他堆栈溢出答案后，我尝试了各种数量的反斜杠。我尝试过简单地对f字符串使用单引号，并在字符串中使用双引号。这些方法都没有奏效。无论我做什么，在传递给我的shell脚本的参数中都存在一个反斜杠，这显然是有问题的。
此外，我已经用我希望通过的形式的参数单独测试了shell脚本，它工作得很好，所以问题似乎不在这一端。
谢谢你的帮助。
回答 1
Stack Overflow用户
发布于 2020-06-16 06:34:14
如果有人来这里寻找答案，我从来没有找到过！我决定将信息存储在系统中的所有容器都可以访问的yaml文件中。我仍然非常想知道将来如何解决这个问题。
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原文链接：
https://stackoverflow.com/questions/62315225
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